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脑卒中（stroke）是世界上三大致死疾病之一，是导致成人慢性残障的最主要因素。脑卒中一旦发作，患者通常会造成残障、认知功能障碍或一些其他的表征，并且具有极高的死亡风险。中国每年脑卒中病人达200万人，目前中风病人约有700万，其中大部分的病人都在不同程度上丧失了劳动力和生活自理能力。缺血性脑卒中占全部脑卒中病人的60-70%，目前已知病因的脑卒中主要分为三种亚型：分别为大动脉粥样硬化型、心源性脑栓塞和小动脉闭塞性卒中。它们在缺血性脑卒中中所占的比例分别为17.3%、9.3%和30.9%。最近一项在澳大利亚人群缺血性脑卒中病人的全基因组关联分析研究显示染色体6p21.1中的单核苷酸多态(SNP)rs556621与缺血性脑卒中高度相关，尤其是大动脉粥样硬化性卒中。研究表明6p21.1的rs556621区域是BCL3和PBX3转录因子结合基序所在的位置，同时该区域附近是预测的多种miRNAs结合的部位，对于基因的表达调控发挥着重要的作用。该区域是研究缺血性脑卒中相关的新的易感区域，迄今为止，这一研究结果还未能在非澳大利亚人群中得到验证。因此探索rs556621与中国汉族人群缺血性脑卒中的关系对于研究脑卒中的发病是很有意义的。本研究采用高分辨率溶解曲线（HRM）和测序相结合的方法在1129例缺血性脑卒中病人和1231例正常人对照中对SNP位点rs556621进行基因分型，并对339例缺血性脑卒中亚型腔隙性脑梗塞和790例非腔隙性脑梗塞缺血性脑卒中进行了分层研究。结果显示，6p21中的单核苷酸多态rs556621与中国汉族人群的缺血性脑卒中(P=0.246，OR=1.129[0.920-1.385])，腔隙性脑梗塞(P=0.142，OR=1.261[0.925-1.717])及非腔隙性脑梗塞缺血性脑卒中(P=0.626，OR=1.060[0.838-1.340])均无显著关联，本研究结果提示SNP rs556621不会导致中国汉族人群缺血性脑卒中的发病风险。种群异质性与人群差异、基因修饰、生活方式的不同和其他的环境因素相关，这也可能是导致SNP rs556621在澳大利亚人群和中国汉族人群中研究结论不一致的主要原因。