【摘 要】
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通过对马的线粒体细胞色素b(cytb)基因全序列的遗传变异分析,来探讨中国家马8个群体、普氏野马、韩国cheju马和日本家马之间的亲缘关系和遗传多样性。运用分子生物学软件分析
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通过对马的线粒体细胞色素b(cytb)基因全序列的遗传变异分析,来探讨中国家马8个群体、普氏野马、韩国cheju马和日本家马之间的亲缘关系和遗传多样性。运用分子生物学软件分析本研究测定蒙古马、普氏野马A系和B系线粒体cytb基因全序列和从Genbank中获得的9个群体37条序列,总共12个群体的DNA多态性,并构建系统发生树。Cytb基因序列变异分析表明:1)马的cytb基因全序列长度一致为1,140bp,无插入和缺失;2)Cytb全序列含52个核苷酸变异位点,33个简约信息位点,其中处于密码子第三位的变异最大,第一位和第二位碱基的变异相对较小;3)Cytb基因全序列中碱基组成富含A,T,A+T含量为54.6%,且第二位点A,T偏向性更加明显,达到61.5%。所有群体在第三位点上碱基G的含量极少,平均仅为5.2%,且在种间表现出4.7%~5.5%的差异。Cytb基因在密码子使用上具有明显的偏向性。4)核苷酸转换远远高于颠换(转换/颠换=14.2),转换主要为C→T、T→C、A→G、G→A,颠换很少发生,碱基替换大都发生在密码子第三位,基因序列中的转换与颠换都未饱和;5)按照cytb蛋白结构模型,cytb基因全序列可分为三个功能区,核苷酸变异多发生在跨膜区。Cytb基因的3’末端比5’末端携带有更多的系统学信息。对东亚的12个马群体进行系统发育分析,使用3种常用的建树方法NJ法、UPGMA法和MP法,所构建的分子树的拓扑结构基本一致。分析表明:1)中国家马具有多个起源或经过多次驯化。2)普氏野马与蒙古马有很近的亲缘关系,推测二者是具有共同祖先的亲戚。3)韩国cheju马与三河马的亲缘关系较近。日本家马与乌珠穆沁马的亲缘关系较近。
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