儿童腺样体肥大组织中EB病毒插入人染色体基因定位研究

来源 :宁夏医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tongxu1
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目的探讨EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)感染导致儿童腺样体淋巴组织病理性增生肥大的作用途径,以及儿童腺样体肥大中EBV在人染色体基因上的作用位点。方法本研究采用下一代基因测序(Next-Generation Sequencing,NGS)技术对16例儿童腺样体肥大标本(11例EBV感染阳性,5例EBV感染阴性)进行基因测序检测,应用生物信息学技术对测序结果进行综合分析,寻找高表达的基因位点。结果在11例EBV(+)标本中,EBV序列原始数据达141.37MB reads,每个样本中病毒序列原始数据总长为52082bp,平均每个样本测得149个整合位点(supported reads≧1)及75个整合位点(supported reads≧2),样本中测得的reads数在制备的病毒序列reads总数上的覆盖率达到30.31%,其中高表达的基因位点有5个,分别为MORF4L2、BTN2A2、SORT1、VAT1和PLB1。5例EBV(-)样本中未检测出与EBV相关的基因位点。结论EBV感染儿童腺样体后通过整合的方式作用于宿主染色体基因促进淋巴细胞增生。本研究共发现整合位点5个,这些整合位点通过影响脂质代谢、B淋巴细胞增生、激活自身免疫应答、上调邻近蛋白质表达等方式造成儿童腺样体组织的增生肥大。
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