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叶斑病是叶组织受局部侵染，导致各种形状斑点病的总称，是经病原物侵害后主要在叶片上发生的各种局部坏死性病斑。叶斑病是近年棉花生产栽培中发生较严重的一种病害，主要侵染植物的叶片，初期在叶片上形成浅褐色水渍状斑点，稍后斑点变褐，后期病斑浅灰色或灰白色，叶片变黄卷曲，提前脱落，从而引起棉花产量及质量的下降。国内对棉花叶斑病的发病症状仅有过记载，还没有相关的系统研究。本研究本文对引起叶斑病的病原真菌的种类及其生物学特性和致病性进行了研究，以及防治药剂的筛选，从而为棉花的抗叶斑病育种及病害的防治提供理论依据。
本研究于2008年5月至2008年8月从江苏省农业科学院植物保护研究所和大丰市植物保护植物检疫站的棉花试验田里采集典型病样，根据柯赫氏法则进行病原真菌分离鉴定，并进行了室内药剂筛选。结果如下：
1．从病叶上分离、纯化获得的117个真菌菌株进行致病性鉴定，其中26株可引起棉花叶斑病。对这26株真菌进行了菌种鉴定包括形态学鉴定和分子鉴定。
通过对生长量的测定，菌落形态，分生孢子和分生孢子梗等形态学观察进行形态学鉴定；通过PCR 扩增真菌核糖体基因转录间隔区（ITS）序列并测序，并将序列在GenBank 上进行同源性比对(BLAST）和构建系统系统发育树等方法进行分子鉴定，鉴定出这26株真菌分属链格孢属(Alternaria)、镰孢属(Fusarium)、黑孢属(Nigrospora)、刺盘孢属(Colletotrichum)、匍柄霉属（(StempHylium)等5个属。其中链格孢属的菌株有14个，占总数的54％，其余4个属的菌株数目少，分别仅占总数的7.7％-15.4％。
2．对上述5个属的26个菌株进行致病性试验，对各个属真菌的侵染症状特点进行详细的观察和记录。根据科赫氏法则从接种发病植株叶片上分离病菌，其形态特征与从自然发病植株上分离的相同，证实这些菌株就是棉花叶斑病的致病菌，其中链格孢属是棉花叶斑病的主要致病菌属3．室内药剂筛选试验研究表明，25％丙环唑乳油、10％世高可湿性粉剂对棉花叶斑病致病菌具有很好的抑菌效果，这两种杀菌剂的作用效果普遍高于其它药剂，是较为理想的化学防治药剂；98％多菌灵可湿性粉剂和25％甲霜灵可湿性粉剂，抑菌效果不理想，对病原菌生长的抑制作用普遍不明显。综合8种杀菌剂对棉花叶斑病致病菌的抑菌效果来看，认为10％世高可湿性粉剂、25％丙环唑乳油、12.5％敌力康可湿性粉剂、50％速科灵可湿性粉剂、50％福美双可湿性粉剂等5种药剂都可以在棉花叶斑病的防治中加以应用。