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进入二十一世纪以来，我国乳业经历了高速发展，奶牛的饲养规模和乳品加工业的规模都在不断扩大，乳业的垂直协作模式也在发生变化，但我国乳业在发展过程中也暴露出很多问题。本文从合约理论角度对农业垂直协作模式进行研究，提出了基于农产品质量的关系合约模型、基于农产品质量的产权理论模型和基于关系合约的农业产业组织垂直协作模型三个模型，并使用相关模型对我国乳业的垂直协作进行研究，得到了一些有意义的结论。 本文的主要研究内容和基本结论如下： 1、对基于合约理论的农业垂直协作研究进行综述。 2、对现代合约农业与畜禽业垂直协作现状进行分析。国外经验显示，在农业垂直协作过程中，没有一种绝对的最优发展模式，农产品品种、消费者对产品质量的评价、农户的议价能力和生产技术条件等因素都会对农业垂直协作模式选择产生影响；在协作方式方面，传统的市场交易方式仍然占主导地位，合约交易方式不断增长，垂直整合方式占比最小。 3、提出基于农产品质量的关系合约模型和基于农产品质量的产权理论模型，使用基于农产品质量的关系合约模型对近期我国原料奶生产的新特点进行分析，并提出政策建议。研究表明，当农产品的质量水平低于社会要求时，如果政府对农产品质量进行管制并对农户进行补贴，不仅可提高产品质量，也可以提高社会总剩余，质量管制条件下，非合约交易方式和合约交易方式（或整合交易方式）都有可能存在；非合约投资在合约条件下会导致农户和农产品加工企业的专有投资不足，在整合条件下会导致农户专有投资不足，农产品加工企业的专有投资过度；乳业新国标部分标准的倒退会导致消费者、中小规模奶牛饲养户和乳品加工企业三方利益受损。 4、提出一种新的基于关系合约的农业产业组织垂直协作模型。该模型显示，资产所有权、关系合约和正式合约均会对农业领域的垂直协作产生影响，关系合约可以有助于改进双方当事人的总剩余和提高产品质量。 5、中国乳业生产率和效率分析。研究发现，在样本期所有规模奶牛的生产率、效率和技术总体呈显著增长，奶牛生产率增长与降低的原因存在差异，“三聚氰胺”事件改变了我国奶牛生产率的增长方式；乳品加工企业存在显著的生产效率的规模效应；我国奶牛饲养业的经济效益、成本与规模成反比，规模较小的饲养方式有更好的经济效益和更低的生产成本。 6、我国乳业的生产率和效率变化对乳业垂直协作的影响分析。研究表明，我国乳业在未来采用合约交易方式和整合交易方式的趋势均存在。 本文的主要政策建议： 1、农业垂直协作形式的选择应遵循以市场选择为主、尊重农户自主选择的原则。 2、强化政府在农产品质量监管中的作用，积极推行农产品补贴政策。 3、政府应该加大对中小规模奶牛饲养户补贴力度，通过市场机制作用提高中小规模奶牛饲养户的原料奶质量水平；对于乳制品加工企业，政府要加强监管、加大对质量违规的处罚力度。 4、要重视散养和小规模奶牛饲养在我国现阶段原料奶生产中的重要地位。 5、鼓励引导农户和加工企业建立基于关系合约的协作关系，农户和加工企业应该建立正式合约与关系合约并存的契约关系，关系合约应看作是正式合约的必要和有益补充。 6、政府相关部门应该积极推动乳制品加工企业的行业整合。