MyD88基因3’-UTR多态性与鸡白痢沙门氏菌抗性关联性分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fyq20061001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
鸡白痢沙门氏菌是现代养禽业中最普遍的细菌性疾病之一。目前,控制鸡白痢感染的手段主要有接种疫苗,药物控制和消除净化,但这些方法都有短板。随着抗病育种工作的开展,通过与分子标记联合选育品种的手段,从遗传水平上筛选先天抗病能力强的群体是对抗病原菌感染最深入有效的方法之一。机体感染鸡白痢沙门氏菌会触发先天性免疫通路。其中MyD88作为TLR家族信号转导通路上最重要的一个衔接蛋白,在抗菌感染相关的研究中受到广泛关注。有研究表明,鸡群在感染鸡白痢沙门氏菌后,MyD88基因表达水平上调,但其mRNA转录后调控的机制并未见报道。3-UTR中的AREs是调控基因转录后表达的功能性元件。AREs通过调节mRNA稳定性和翻译效率来调控蛋白的生物学活性是近年的研究热点。而MyD88基因的3-UTR与机体是否易感鸡白痢沙门氏菌的关系尚未见报道。  为了探索MyD88基因的3-UTR中单核苷酸多态性是否与抗鸡白痢沙门氏菌感染相关,我们对优质SD鸡连续两个世代,SD04世代和SD05世代进行了遗传关联研究。两个世代共4,400只300日龄种母鸡经全血平板凝集检验鸡白痢沙门氏菌后,将阳性个体集成2个病例组,分别包含SD04世代81例,SD05世代61例;阴性个体集成2个对照组,分别包含SD04世代90例,SD05世代66例。所有样本血样静脉翅下采取,然后采用苯-氯仿萃取法提取全基因DNA,扩增样本MyD88基因的3-UTR区域片段,测序后筛选单核苷酸多态性位点。通过R软件对同世代SNP进行卡方检验,对比两个世代间位点、等位基因频率和基因型频率在病例-对照组中分布的差异性。同时,对SNP位点构建的单倍型进行关联鸡白痢抗病性分析。结果发现:  1.两个世代共筛选出13个SNP,其中10个SNP符合哈迪-温伯格平衡。SD04世代中SNP4(g.4810293 C>A)等位基因频率和基因型频率在病例-对照组之间分布都存在显著差异(p<0.05)。并且,SNP4的OR值等于0.6088,95%CI为0.531-0.9759,说明该位点对感染鸡白痢沙门氏菌有抵抗作用。SD05世代中只有SNP13等位基因在病例对照组之间分布存在显著差异(p<0.05),并且SNP13的OR值为1.8012,95%CI为1.0247-1.4827,说明SNP13对鸡白痢沙门氏菌易感。  2.SD04世代中SNP1、SNP2(g.4810266A>G,g.4810372 C>T)组成的单倍型GG,AA,以及SD05世代中SNP1、SNP2和 SNP11组成的单倍型GTG、ACA、GCG、ACG和GCA,在病例对照中分布不存在显著差异(p>0.05)。但SD04世代中位点 g.4810266 A>G与g.4810372 C>T;位点SNP5(g.4810191 A>G)和SNP6(g.4810253A>G)与位点SNP7(g.4810276 C>T),g.4810293 C>A,SNP8(g.4810352 C>T)均存在强连锁不平衡,与SD05世代不同,连锁不平衡被削弱,说明SD04世代阳性个体的淘汰改变了SD05世代鸡白痢沙门氏菌位点的易感或抗病性。  以上结果表明,不同世代,不同位点的多态性所表现的抗病性或易感不同。但总体来说,MyD88基因的3-UTR中单核苷酸多态性位点与鸡白痢沙门氏菌感染有一定关联性,在进行分子辅助标记选种时,本试验数据中位点可提供参考。
其他文献
目的:探讨胃镜在急性上消化道出血诊治中的临床应用价值.方法:对30例上消化道出血患者在48 h以内进行胃镜检查,并对有活动性出血的病例给予相应的止血治疗.结果:本组患者插管
老年人随着年龄的增长,机体各组织器官机能减退,导致机体整体调节机能减退.老年患者心理状态与个体差异很大,因此在老年人的心理护理中我们应根据老年人的生理特征及心理特点
目的:对铝碳酸镁结合奥美拉唑治疗胃溃疡合并胃出血的治疗结果进行试验检测.方法:抽取我院于2015年9月-2016年3月收治的患有胃溃疡合并胃出血的78例患者作为实验对象.分成试
目的:研究老年抑郁症患者的反应抑制能力受损状况及其影响因素,为干预提供依据.方法:纳入符合CCMD-3诊断标准的老年抑郁症患者和正常对照各32例,收集其一般人口学数据.采用St
青少年观众收看电视行为与心理分析张令振自从1958年我国创办电视台以来,我国的电视事业经过35年的发展已取得了巨大的成绩,据有关部门统计,到1993年6月,我国已建有电视台614座,电视机社会拥有量达2.4亿台,电视观众人数超过了8亿,而在这8亿观众...
目的:了解精神科护士工作压力及亚健康状况,明确工作压力与亚健康状态间的关系.方法:采用随机抽样方法,选取我院精神科近年来在岗和进修轮转的30名护士接受问卷调查.1周后收
目的:探讨在临床护理工作中利用一次性培养皿防止针刺伤的可行性和优越性.方法:以我院40名护士为观察对象,在集中输液或采血过程中利用一次性培养皿收集使用后的针头并在输液
目的:分析右美托咪定、氯胺酮预防小儿七氟醚麻醉术后躁动的临床效果.方法:取80例七氟醚麻醉手术患儿进行研究,实验组40例采用右美托咪定,对照组采用氯胺酮,比较两组躁动评分
处方点评是根据《处方管理办法》[1]、《抗菌药物临床指导原则》[2]和《医院处方点评管理规范(试行)》[3]等的规定,对处方实行动态监测及超常预警,登记并通报不合理处方,对不
目的:探讨针灸结合中药疗法治疗风湿病的临床效果.方法:选取2013年4月~ 2015年6月我院收治入院的84例风湿病患者,随机分为两组,各组42例,对照组行常规治疗,观察组在对照组治疗