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[目 的]本研究旨在对昆明市2015-2019年HIV/AIDS治疗失败患者进行耐药流行病学调查,探讨耐药扩增阳性率及耐药发生的影响因素;另一方面对该部分患者HIV-1毒株基因亚型分布及耐药株与敏感株间基因的变异情况进行描述,探究和溯源毒株流行地域和时间。[方 法]收集昆明市2015年-2019年抗病毒治疗失败(ART)患者流行病学信息,并采用In-house耐药检测方法进行基因型耐药检测。通过RT-PCR方法扩增HIV-1病毒pol基因区长度约为1200bp的片段,测序后运用Bio edit和MEGA 6.06软件进行编辑校对,通过艾滋病耐药数据库(hivdb.stanford.edu)得到序列的基因亚型、耐药突变位点等基因型耐药信息;通过MEGA、Beast等软件进一步进行基因变异分析。[结 果]1.2015-2019年昆明地区HIV/AIDS ART失败患者共收集到1434例,中位数年龄为40(33,48)岁,男性占比66.46%(953/1434),异性性接触占63.39%(909/1434),抗病毒治疗方案以 EFV+TDF+3TC 为主(33.47%,476/1434)。以2019年12月31日累计治疗人数22640为基数,5年累计治疗失败率为6.33%;扩增阳性率为83.82%(1202/1434),其中东川区扩增阳性率高于昆明市区(OR=2.186,95%CI:1.149-4.160),富民县扩增阳性率低于昆明市区(OR=0.467,95%CI:0.222-0.982),女性检测阳性率高于男性(OR=1.581,95%CI:1.141-2.192)。2.2015-2019年间昆明市HIV/AIDS抗病毒治疗失败患者总体耐药率为57.74%(694/1202),5 年累计耐药率为 3.06%(694/22640),NRTIs、NNRTIs和 PIs 的总体耐药率分别为 35.27%(424/1202)、53.41%(642/1202)和 4.99%(60/1202);组合耐药以 NRTIs+NNRTIs 的发生率最高(30.20%,363/1202)(χ2=588.067,P=0.000);昆明市总耐药发生率及各类药物的耐药发生率5年里无变化趋势(P>0.05)。耐药影响因素结果显示,女性为保护性因素(OR=0.736,95%CI:0.558-0.971);以母婴传播为比较基准,静脉药瘾以及其他传播途径为保护性因素(OP<1,P<0.05);NVP+AZT+3TC治疗方案的耐药发生率是EFV+AZT+3TC治疗方案的 2.093 倍(OR=2.093,95%CI:1.395-3.141),而克力芝+AZT+3TC治疗方案的耐药发生率是EFV+AZT+3TC治疗方案的0.526倍(OR=0.526,95%CI:0.319-0.868);把昆明市区作为比较地区,安宁市、关爱中心、东川区、嵩明县均为保护性因素(OR<1,P<0.05);以CRF01_AE亚型为基准,CRF07_BC和CRF08_BC是耐药发生的保护性因素(OR<1,P<0.05)。以上耐药率差异主要是对NRTIs的耐药率差异引起(P<0.05)。突变位点及类型中,NRTIs突变以M184I/V 突变率为最高(29.78%,358/1202),其次为 K65R(9.40%,113/1202)。NNRTIs突变以K103N/S/R/E突变率最高,占20.80%(250/1202),其次为V179D/E/T,占13.06%(157/1202)。PIs突变率排前三的依次为M46E/K/V/I/L(1.41%,17/1202)、L33F(1.25%,15/1202)以及 Q58E(1.25%,15/1202)。3.昆明地区ART失败患者中,CRF08_BC占比最多(45.50%,547/1202),CRF01_AE、B亚型和其他亚型与同性性接触及关爱中心相聚集;CRF07_BC与安宁市、东川区、静脉药瘾相聚集;CRF08_BC与晋宁县、石林县以及女性相聚集。基因距离比较方面,CRF01_AE的耐药株大于敏感株(P<0.05),CRF07_BC和CRF08_BC 与 CRF01_AE 相反(P<0.05);Ka/Ks 比较方面,CRF01_AE 的耐药株小于敏感株(P<0.05),而CRF07_BC却是耐药株低于敏感株(P<0.05)。4.CRF01_AE的系统进化树显示,耐药株与敏感株大部分的序列与山东省2013年的序列和天津市2007年的序列靠近,剩余的少部分序列则与云南省早年(2007年)及越南、泰国等周边国家早年(2000年前)的序列靠近。在耐药株流行簇中,最早的tMRCA在2001.08(1986.10-2012.09),而最近的流行簇tMRCA在2017.08(2015.10-2018.12),敏感株流行簇中最早的流行簇tMRCA是2002.08(1996.11-2007.01),最近的流行簇 tMRCA 是 2016.10(2014.09-2017.11)。[结 论]1.2015-2019年昆明市5年累计治疗失败率为6.33%,且在云南省内为中度流行;进一步完善个别地区的管理可增加检测阳性率。2.2015-2019年昆明市HIV耐药率处于稳定趋势,且在全国处于低水平流行;对NRTIs耐药率的差异是导致整体耐药率有差异的主要原因,对NRTIs药物的使用和管理需更加谨慎;与云南省总体耐药位点突变率不同,M46在PIs中的突变比例高于云南省。3.昆明市ART失败人群HIV-1毒株以CRF08_BC为主;CRF01_AE的耐药率高,其耐药株与敏感株在疾病进展速度上均高于其他亚型。4.近年昆明CRF01_AE ART失败患者毒株来源于北方省份;昆明市最早的CRF01_AE耐药患者毒株可能为传播性耐药传入,对传播耐药的防控需要及时加大力度。