Callipyge,Meg3和DLK1基因单核苷酸多态性及其与绵羊生长发育性状的相关性研究

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以典型群随机抽样的方法在宁夏回族自治区贺兰和盐池县分别采集87头滩羊、73头特克塞尔、70头萨福克和112头无角陶赛特的耳组织样。采用PCR-SSCP的方法研究了Callipyge,Meg3和DLK1基因部分片段的多态性,同时辅以PCR-RFLP方法检测决定Callipyge表型的单碱基A→G的突变,并分析三个基因的不同基因型与生长发育性状之间的相关性。结果如下:1.在四个绵羊品种中没有检测到决定Callipyge表型的A→G单碱基突变,但在该位点上游35bp处检测到一个C→T的突变,表现为三种基因型,为AA、AB和BB型,在滩羊、特克塞尔、萨福克和无角道塞特四个绵羊品种中的突变率为0.121、0.041、0.329、0.054。2.对绵羊、山羊、牛、猪、马、狗和兔的Callipyge基因进行同源性分析,并构建物种间分子进化树,结果显示绵羊与山羊首先聚为一类,然后依次与牛、猪、马和狗聚为一类,最后和兔聚在一起,和动物分类学结果基本一致。3.对位于Callipyge基因两侧的Meg3和DLK1基因的部分序列进行SSCP分析,检测到一些新的突变位点,DLK1基因共检测到五个突变位点,分别为54507处的G→C突变、54553处的T→C突变、54592处的C→T突变、54620处的C→T突变、54638处的T→G突变,表现为五种单倍型D-1、D-2、D-3、D-4、D-5。Meg3基因检测到两个突变位点,分别为139069处的A→G突变和139128处的G→A突变,表现为三种单倍型M-1、M-2、M-3。4.对Meg3和DLK1基因各SNP位点进行统计学分析表明,M1、M2位点间存在强的连锁不平衡(P<0.01)。D1和D2、D3、D4、D5位点,D2和D3、D4、D5位点,D3和D5位点间存在强的连锁不平衡(P<0.01)。M1和M2位点,D1和D2位点的基因频率、基因型频率、杂和度、多态信息含量等指标完全一致。对四个绵羊群体Meg3和DLK1基因7个SNP位点进行Hardy-Weinberg平衡检测结果表明,得克塞尔群体的D3和D5位点,萨福克群体的M1、M2位点偏离平衡状态(0.01<P<0.05),其余位点处于平衡状态。5.对影响生长发育性状各指标的分析表明,品种效应占主导地位,品种与生长发育性状间存在极显著相关性(P<0.01),性别对生长发育性状影响不显著(P>0.05),进一步分析四个绵羊群体三个基因的不同基因型和单倍型对生长发育的影响表明:Callipyge,Meg3和DLK1基因对无角陶赛特、萨福克和得克塞尔群体的生长育性状影响不显著(P>0.05),Callipyge和Meg3基因的不同基因型和单倍型在滩羊的体高,体长和胸围性状上存在显著差异(0.01<P<0.05)。
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