【摘 要】
:
HIV-1整合酶是艾滋病病毒复制过程中不可缺少的一种酶,所以整合酶是一个寻找治疗HIV药物的理想靶点。在所报道的整合酶抑制剂中,β-二酮酸类化合物作为一系列抑制性较好的配体
论文部分内容阅读
HIV-1整合酶是艾滋病病毒复制过程中不可缺少的一种酶,所以整合酶是一个寻找治疗HIV药物的理想靶点。在所报道的整合酶抑制剂中,β-二酮酸类化合物作为一系列抑制性较好的配体分子,现在已经有药物进入了临床研究。本文根据文献报道的7个对HIV-1整合酶的链转移反应有抑制性能的二酮酸类似物,用分子对接方法、分子动力学(MD)模拟方法研究它们的结合模式、结合强度等。论文主要包含以下几个方面的工作:
用分子动力学方法对两个HIV-1整合酶体系进行溶液动力学模拟,其中另一个不含金属离子,而另一个含有Mg2+,得到了整合酶的合理构型,通过对模拟轨迹的分析,阐明了Mg2+的存在对体系活性中心区域起着稳定的作用。
用分子对接方法研究二酮酸类似物与HIV-1整合酶的相互作用。研究发现,含Mg2+的整合酶体系比不含Mg2+的整合酶体系对接效果要好。对接性能较好的抑制剂有两种结合模式,一种是以酮-烯醇式部分为结合位点与Mg2+发生螯合作用,另一种是以羧酸或者磺内酰胺基为结合位点与Mg2+螯合。并且应用分子动力学方法对复合物进行模拟,以确定这种结合模式的合理性。
对的两种结合模式分别进行了模拟,发现它们的结构基本上能达到稳定状态。此外,抑制剂和Mg2+离子在与HIV-1整合酶的核心活性区域的作用中起着协同促进的抑制作用,二者的共同存在促进了体系的稳定性,并加强了对整合酶活性中心的作用能力。
其他文献
随着网络媒介的迅速发展,《人民日报》的前途一直深受社会和业界的关注,新世纪以来《人民日报》进行多次改版,为报业发展提供了新的内容。在网络环境下《人民日报》尝试实践
芳基砜类及其衍生物是一类非常常见的有机合成中间体,具有重要药物活性,在农药和医药领域应用广泛。因此对芳基砜类化合物的合成研究具有重要的意义。本论文发展了一种钯催化合成芳基砜类化合物的新方法,它是首个钯催化的硝基芳烃和亚磺酸盐的脱硝基偶联反应,在环钯二茂铁亚胺二聚体的催化条件下实现了芳基砜和杂环砜类中等到较高的收率。研究结果表明,0.3 mmol的硝基芳烃和0.6 mmol的亚磺酸盐,在环钯二茂铁亚
乡镇干部辞职下海现象增多是乡镇干部队伍建设中出现的一个新动向。据调查,某县乡镇干部1998年辞职1人,1999年为2人,2000年已增至9人。乡镇干部辞职下海,不管是出于何种动机
苦豆子为豆科槐属、多年生草本根茎地下芽植物,其主要化学成分有生物碱和黄酮等。但作为药品开发,国内外研究的重点主要放在生物碱上。近年来有关苦豆子黄酮类成分的研究尤其是
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。
Please download to view, this article does not support online access to view profile.
在延安革命纪念馆里陈列着一辆小纺线车。参观的人们看到它,会自然地联想到当年延安军民大生产运动,联想到周恩来副主席纺线,联想到南泥湾的歌声……它,就是这一光辉历史的见证。
杂环化合物在医学、农业学、材料科学以及有机合成中有着广泛的应用,其合成方法也倍受化学家们的关注。单质碘由于廉价易得、毒性较低而在有机化学中独树一帜。在本论文中,我们
根据世界投入产出数据库计算的中国同世界主要国家的产业同构性表明,2000-2014年期间中国同世界上大部分国家间存在较高的产业结构趋同,而与不同国家之间的产业同构性又存在
本文首先对新一代光敏药物酞菁配合物的结构、性质、合成方法和应用做了介绍,并简述了药物分子与血清白蛋白作用的研究方法。 以高锰酸钾为氧化剂氧化降解2-萘酚-6-磺酸钠合成“分子碎片”4-磺酸钾基邻苯二甲酸。以4-磺酸钾基邻苯二甲酸为原料,铝酸铵为催化剂,采用“分子碎片”组装方法合成了具有C_4h结构的四磺酸基酞菁铝(AlPcS_4)、四磺酸基酞菁钴(CoPcS_4)和具有D_(2h)结构四磺酸
有机小分子催化反应已成为化学合成的一个重要领域,它是设计和开发新型手性药物、材料等的重要方法。近年来,人们越来越关注有机小分子催化剂,它已成为化学领域的一个研究热点。鉴于有机小分子催化高效性和对产物的高立体选择性,有机小分子催化成为了构建分子骨架的重要工具。作为21世纪初出现的一个新概念,有机小分子催化一直在飞速发展并成为有机化学学科的一个重要研究方向,其黄金时代也已来临。事实上,有机小分子催化反