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肠道病毒71型病毒(Enterovirus71，EV71)，属于小核糖核酸病毒科(Picornaviridae)肠道病毒属(Enterovirus，EV)，是一类能引起儿童手足口病等重大疾病的重要病原体。EV71为正单链RNA病毒，由7，500～8，000个核苷酸构成，仅含有一个开放阅读框架（open-readingframe，ORF）。EV71的基因组两端有两个非编码区，分别为746bp的5’非编码区(UTR)和83bp的3’非编码区。EV71基因组的编码区负责编码由2194个氨基酸构成的多聚蛋白(polyprotein)。多聚蛋白可进一步水解为11个蛋白质，其中VP1-VP4为结构蛋白，2A、2B、2C、3A、3B、3C、3D为非结构蛋白。
EV71病毒的3C蛋白酶属于半胱氨酸蛋白酶家族（cysteineproteasefamily），具有半胱氨酸蛋白酶常见的催化活性区域。3C蛋白酶的催化部位由His40，Glu71和Cys147构成，主要负责特异性地切割Gln-Gly两个残基之间的酰胺键。另外，3C蛋白酶还可以裂解宿主细胞内的多种蛋白，影响宿主细胞正常的生命活动。
本课题以EV71的3C蛋白酶为靶点，设计并合了成具有醛基结构和不同P3位基团的多个系列戊内酰胺类化合物，并在细胞水平上对其进行活性测试，研究其构效关系。测试结果显示，12个戊内酰胺醛类抑制剂中，c1和c9的抑制活性最佳，细胞病变效应筛选（Cytopathiceffect，CPE）的测试结果都达到了CPE50=1.56μM。通过构效关系研究可发现:戊内酰胺环类抑制剂的P3位点苯环上取代基类型、取代基数目、取代位点、P3位基团脂肪链长度对其抑制EV71病毒的效果有很大的影响。