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水生丝孢菌是淡水真菌的主要类群之一，广义的水生丝孢菌是指生活史的部分阶段或整个生活史依赖水环境的丝孢菌类，分类学上属于担子菌和子囊菌的无性型。水生丝孢菌在生态系统的能量代谢和物质循环中起着重要的作用，此外在解决重金属污染，水污染，发掘真菌代谢产物的领域也有潜在价值。1942年，Ingold掀开了水生丝孢菌的研究序幕，至今已有70多年的研究历史，但就中国来说，水生丝孢菌的研究起步较晚，从事水生丝孢菌的研究人员相对较少，大量的资源亟待我们研究和发现。 本研究对云南省以及贵州省等部分地区的水生丝孢菌多样性进行调查。基物采集地包括云南省西双版纳自然保护区，迪庆属都湖自然保护区，迪庆普达措国家公园，思茅，哀牢山自然保护区，贵州省雷公山国家级自然保护区，梵净山国家级自然保护区，宽阔水自然保护区，海南吊罗山自然保护区，广西十万大山保护区，广西大瑶山自然保护区。采集水中长期浸泡的腐叶300多份，经富集培养、分离鉴定，共纯化得到水生丝孢菌200多株，目前鉴定出50多个属，本文详细介绍了40个属，包括42个种，其中1个新属，5个新种:Jaculispora sinensis, Setosynnemayunnanense, Seychellomyces sinensis,Verticicladus sinensis;6个中国新记录属:Arxiella，Beejadwaya，Heliocephala，Jaculispora，Retiarius，Seychellomyces;1个中国大陆新记录属:Ardhachandra;7个中国新记录种:Arxiella terrestris，Beejadwaya bispora，Heliocephala proliferans,Ochroconis cordanae,Retiarius superficiars,Sublispora longirostrata，Sympodioplanus capensis;2个中国大陆新记录种:Ardhachandra cristaspora，Campylospora parvula;28个中国已报道种。