用磁镊研究DNA凝聚及DNA与蛋白质相互作用

来源 :中国科学院物理研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangys
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本论文主要进行了以下三个方面的研究工作:首先,笔者对传统的磁镊装置进行了改进,接下来,用这种改进后的磁镊装置分别研究了DNA分子在双子型阳离子表面活性剂C12C6C12Br2作用下凝聚的动力学过程以及SpoIIIE蛋白运输DNA的动态过程。论文工作中主要取得了以下有意义的研究进展:   (1)通过对横向磁镊装置的改进,使其兼备了纵向以及横向磁镊装置的优点:实验过程中,既能很直观地观察并检测到单个DNA分子的伸展长度,又能随时更换样品池里面的溶液,而且一次实验可以同时操纵多个单根的DNA,大大提高了实验效率;此装置还可以简化样品制备过程,降低实验成本,提高实验过程的稳定性、可重复性以及实验的成功率;另一方面,此方法可以提供10-1到102 pN范围的力,足以满足大部分单分子DNA实验的要求。这对于单分子研究的进一步普及及深入研究有重要意义。   (2)通过研究DNA分子在双子型阳离子表面活性剂C12C6C12Br2作用下凝聚的动力学过程,并跟踪了此过程中DNA凝聚形态的变化,笔者发现:DNA分子的凝聚给出一种新的凝聚体形态;凝聚过程分为两个阶段:在初始阶段,“串珠”状结构逐渐形成,然后,这些“串珠”进一步互相堆积,自组装为高级聚集体;在高级聚集体里,这些珠状结构单元并不互相融合,而是保持各自的独立性。这-C12C6C12Br2诱导下的DNA凝聚过程与染色体的形成过程具有极高的相似性。   (3) SpoIIIE蛋白运输DNA的动态过程显示:类似于FtsK蛋白对特定碱基对特定位点的识别作用,SpoIIIE对入DNA上面的某部分片段可能也存在着识别作用;SpoIIIE蛋白在这个片段位点指引下,在DNA上向着特定的方向行走;通过对实验曲线中不同类型的DNA缩短和伸长曲线进行统计,并经过相应的理论计算,笔者提出了SpoIIIE在DNA运动的模型。
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