影响棕色和白色脂肪分化相关长链非编码RNA表达谱特征研究

• 作 者: 陈建涛
• 机 构: 新乡医学院
• 出 处: 新乡医学院
• 发表日期: 2015年期
• 关键词: 棕色脂肪组织 白色脂肪组织 长链非编码RNA 脂肪形成

背景长链非编码RNA(LncRNAs)是参与多种生物功能普遍存在的一类重要基因,它可以作为参与转录调控的关键共活化因子。众所周知,白色脂肪的功能是贮存能量而棕色脂肪是消耗能量。白色和棕色脂肪细胞均起源于中胚层。然而,目前尚不清楚LncRNAs是否在棕色脂肪和白色脂肪的能量代谢和成脂分化中起到作用。目的研究LncRNAs在棕色和白色脂肪中表达谱的差异特征,明确LncRNAs是否参与棕色脂肪和白色脂肪的能量代谢和成脂分化这一生物过程。为今后在治疗肥胖提供了理论基础。方法首先,采用免疫组化法来鉴别棕色脂肪,随后分别提取棕色脂肪和白色脂肪的总RNA并对总RNA的质量鉴定；采用实时荧光定量PCR,对这些差异倍数大的LncRNAs进行验证；为了揭示这些LncRNAs的潜在功能,通过GO和Pathway分析方法,对这些表达差异的LncRNAs进行了分析,并且通过斯皮尔曼相关分析和生物信息学分析对基因AK142386和AK133540的潜在相关靶基因进行了预测；结果解偶联蛋白-1(uncoupling protein-1 UCP-1)免疫组化显示阳性着色较深的为棕色脂肪组织；利用第二代测序技术和芯片技术,通过比较棕色脂肪组织和白色脂肪组织分化相关LncRNA表达谱特征,发现了735个上调和877个下调的LncRNA(差异倍数大于4)。实时荧光定量PCR结果显示所挑选出的基因差异性表达符合芯片结果；GO和Pathway分析,发现了AK142386和AK133540影响了脂肪生成和能量代谢；斯皮尔曼和生物信息学分析,Hoxa3和Acad10分别是基因AK142386和AK133540的相关靶基因,推测可能通过其影响能量代谢。结论通过实验验证和生物信息学的方法,分析了棕色脂肪和白色脂肪LncRNA的差异表达谱特征,也证实本研究芯片数据有较高的可重复性,总之通过芯片结果已经确定了大量的LncRNAs,这些LncRNAs在脂肪形成和能量代谢中具有重要的调控功能。