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近年来，随着治水思路由工程水利向资源水利，并最终向生态水利的转变，国内水利工程的功能在不断转变，除了满足防洪、发电、航运、排涝、供水等社会经济发展的需求外，开始注重对区域生态和生态系统的影响研究，并重视对生态和生态系统的保护和修复。研究水利工程的生态效应区域响应，对于实现区域社会、经济与生态系统的可持续发展和水资源可持续利用，实现人与自然的和谐相处具有重要的意义。论文在论述生态系统结构和功能、生态效应区域响应的概念、特点、研究内容、效应分类等的基础上，以水文学、生态学、环境科学的基本理论为依据，重点研究以下内容：1、按产生响应的生物营养级别的高低顺序，分第一级响应、第二级响应和第三级响应等三个响应层次进行识别；2、采用层次分析法，建立水利工程的生态效应区域响应评价指标体系框架和综合指数评价模型；3、考虑生态效应区域响应存在正负效应响应的实际，将水利工程的生态效应区域响应评价综合指数划分为相应的八个级别；4、以飞来峡水利枢纽工程为实例，就该工程的生态效应区域响应进行了分析和评价，并提出了减轻或消除生态负效应的对策措施。研究结果表明：飞来峡水利枢纽工程的生态效应的区域响应总体上表现为正效应，但生态正效应比较弱，随着气候变化和人类活动影响加剧，如果工程管理和运行措施不当，则易导致负效应的出现。