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清末民初的中西医论争是近代中西文化之争的一个问题层面，随着中西文化之争的进程加剧，中西医之争也愈显剧烈。本文力图通过简述中西医论争的简史，凸现社会各阶层的反应与认知以及中西医界自身的认知，来折射其后反映的深层文化现象，面对中西医并存的近代中国医界，来探寻清末民初中国医学发展的思想特征与文化现象。全文主体部分共有三章: 首先通过分析清末民初传统中国医学衰落的原因和西方医学输入之后的发展过程来简单回顾中西医论争的简史，为下一步的论证西学东渐过程中的中医冲突的表现做铺垫。其次通过深入分析社会各阶层对中西医的认知与回应，中西医界在论争中各自的认知和表现，来反映二者论争的实质是从学理之争到政治之争。最后通过二者的差异来折射中西医论争中所表现的文化现象。如东西文化观中两种文明的交接、清末民初中西医论争中隐含的近代文化思潮，来展望和传统文化密切关联的中医的未来发展方向。 二种文化的差异注定了在社会变革中的中西医有着某种共存性。历史也表明对抗与排斥无法解决问题，只有在创新和发展中二者才能共赢。