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20世纪70年代以来，东亚经济取得了显著的成就，一度被誉为东亚奇迹，但是长期以来该地区一直缺乏有效的经济合作制度。1997年东亚金融危机的爆发，以及欧盟和北美区域经济合作迅速发展的引导，使得东亚国家充分地认识到区域经济合作的制度建设不可或缺。日本、东盟作为东亚区域十分重要的经济体，审时度势，早在20世纪70年代就已开始构筑一系列的经济合作制度，远远领先于东亚区域整体合作制度的建设。在东亚区域经济合作制度化的过程中，日本-东盟区域经济合作起到了很好的示范作用，有力的推动着东亚区域经济合作的进程。
本文主要分为三部分：导论、正文(共四章)和结论。
“导论”部分阐述研究的背景、国内外学者对于相关课题的研究现状、本文的选题意义和研究方法。
第一章“国际区域经济合作理论”，介绍了国际区域经济合作的定义，将国际区域经济合作划分为功能性区域经济合作和制度性区域经济合作两种形式，重点论述国际区域经济合作中的国际制度理论，指出制度理论对于国际区域经济合作的意义，为全文的理论贯穿奠定基础。
第二章“日本-东盟区域经济合作”，从日本与东盟的贸易、投资和援助领域合作的角度分析日本-东盟功能性区域经济合作现状，在此基础上，论述日本-东盟区域经济合作的制度化进程，并提出其制度建设中存在的问题。
第三章“日本、东盟与东亚区域经济合作”，分析东亚区域经济合作的制度建设及其存在的问题，论述日本、东盟在东亚区域经济制度化合作中的地位和表现，其后阐释东亚区域经济合作的制度建设对日本、东盟的作用。
第四章“日本-东盟区域经济合作推动东亚区域经济合作”，展望日本-东盟区域经济合作的前景，预测双方将深化经济合作关系、扩大经济合作范围以及进一步深化区域经济合作的制度建设等；从两个方面论证日本-东盟区域经济合作的制度建设将推动东亚区域经济制度化合作进程，包括日本-东盟区域经济制度化合作为东亚提供“示范”先例和主导力量等等。
“结论”部分在前面各章节的基础上，总结日本-东盟区域经济制度化合作对于迫切要求制度化的东亚区域经济合作的重要性。