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甘露糖结合凝集素相关的丝氨酸蛋白酶-2（mannan binding lectin-associated serineprotease 2，MASP-2）是补体凝集素溶血途径中的重要一员，在启动补体凝集素溶血途径中发挥着至关重要的作用。MASP-2主要在肝脏中表达，与MBL（Mannan-Binding Lectins）或纤维凝胶蛋白（ficolin）分子结合形成大分子复合物，有着重要的生物学功能。本论文着重研究了以下三个方面：1．MASP-2基因多态性与奶牛生产性状关联性分析本课题以759头中国荷斯坦奶牛为研究对象，检测了MASP-2基因的单核苷酸多态性（SNPs）位点，对MASP-2基因多态性与荷斯坦奶牛产奶性状（305天产奶量、乳脂率、乳蛋白率）、SCS（Somatic Cell Score，体细胞评分）进行关联性分析，筛选与奶牛产奶性状相关的SNP，意在为未来培育出绿色健康，高产奶量、高乳脂率和高乳蛋白率的荷斯坦奶牛提供可用的分子标记和理论依据。经DNA测序和相关目的序列比对发现，MASP-2基因中g.-282 G>A，g.478 G>A，g.506G>A，g.511 T>C和g.13808 G>A存在5个新的SNP位点。g.-282 G>A处于5’侧翼区；g.478G>A，g.506 G>A，g.511 T>C处于第3外显子区，其中g.506 G>A突变导致MASP-2蛋白第102位的的甘氨酸突变为丝氨酸，g.478 G>A位点突变后第92位丝氨酸不变，g.511 T>C位点突变后第103位天冬酰胺不变，两个都为同义突变；g.13808 G>A处于第11外显子，它的突变能够导致MASP-2蛋白第529位天冬氨酸突变为天冬酰胺。应用PCR-RFLP等试验方法对MASP-2基因进行分型后发现，g.-282 G>A，g.478 G>A，g.511 T>C三个SNP位点完全连锁。数据分析后发现MASP-2试验牛群中SNPs组成的单倍型有13种，有7种单倍型组合的数量满足统计分析要求，其中H1H2单倍型的产奶量最高，H1H4单倍型的乳脂率最高，H1H8单倍型组合的乳蛋白率最高而且SCS最低，为乳腺炎抗性单倍型组合。2．MASP-2基因可变剪接体的鉴定根据典型奶牛乳腺炎症状和体细胞评分数据，分别采集3头健康组（Healthy）和3头患乳腺炎组（Mastitis）中国荷斯坦牛各组织样品。经RT-PCR和克隆测序后发现MASP-2基因存在四种可变剪接体，分别命名为MASP-2 A125，MASP-2 A145，MASP-2 A25，MASP-2 A245，全转录本命名为MASP-2 complete。四种可变剪接体形式分别为内含子保留和外显子缺失。在随机挑取的35个单克隆中，四种可变剪接体出现的总频率为22.9 %。五种转录本均主要在肝脏中表达，分析发现在乳腺炎牛中MASP-2 complete是主转录本，在健康牛中MASP-2 complete、MASP-2 A25相对于其它的转录本表达量较高。MASP-2A125，MASP-2 A245转录本在乳腺炎牛和健康牛中的表达量存在显著性差异（P < 0.05），而MASP-2 A25差异极显著（P < 0.01）。3．MASP-2基因启动子活性分析以牛基因组序列为基础，克隆了中国荷斯坦奶牛MASP-2基因的上游调控序列，并利用在线预测软件对其进行了生物信息学分析，构建出了具有不同长度的缺失片段表达载体，利用双荧光素酶报告活性系统,瞬时转染人肝癌细胞（HepG2细胞）和人胚肾上皮细胞（293T细胞）后，分析了MASP-2上游调控序列不同长度片段的启动子活性。研究发现牛MASP-2基因启动子的表达不具有严格的细胞特异性，在两种细胞中都有启动子活性。进一步研究发现该段上游调控序列虽然在293T细胞中也有启动子活性存在，但是活性明显弱于HepG2细胞中的启动子活性，在肝癌细胞中+245—+577 bp处有基础启动子活性。结果显示在基因的-1915—1136 bp和-666—-244 bp处存在负调控元件，在-1136—-666 bp和-244—+245 bp处存在正调控元件。