岗梅三萜皂苷生物合成相关修饰酶CYPs和UGTs的发掘与功能研究

来源 :广州中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:houguangyun1981
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
岗梅为冬青科(Aquifoliaceae)植物梅叶冬青Ilex asprella(Hook.et Arn.)Champ.ex Benth.的根,是岭南地区常用的清热解毒中药材之一。其主要含熊果烷型的三萜皂苷,一类由α-香树酯醇(α-amyrin)衍生而来的五环三萜类化合物。岗梅熊果烷型三萜皂苷拥有广泛的生理活性,具有较高的药用价值,然而不论是利用植物化学分离还是通过化全合成均较难以大量获取,限制了人们对这类成分的开发利用。近年来新兴的合成生物学为大量获取该类化学成分提供了一种潜在的有力手段,即通过解析目标化合物的关键酶基因,将这些外源基因引入微生物等宿主细胞中进行异源代谢,有望能快速大量地获取该类化合物。岗梅三萜皂苷母核α-amyrin形成的关键酶基因(IaAS1)已经鉴定,但合成途径下游与母核修饰相关的多个CYPs氧化酶和UGTs糖基转移酶尚不明确,有待于深入研究。  目的:  通过对转录组数据的深度挖掘,筛选岗梅中与三萜皂苷生物合成相关下游途径关键修饰酶(氧化酶CYPs和糖基转移酶UGTs),并加以功能验证,获得三萜皂苷生物合成关键元件,为阐明岗梅三萜皂苷生物合成途径和构建合成三萜皂苷的酵母细胞工厂奠定基础。  方法:  1.候选CYPs和UGTs基因的筛选与克隆  利用外源激素(茉莉酸甲酯)喷施岗梅地上部分,,取样进行转录组测序。将获得的岗梅叶与前期获得的转录组根数据合并,重新组装,分析诱导后CYPs、UGTs的差异表达基因,并利用已鉴定的与三萜皂苷生源途径相关的CYPs和UGTs基因与岗梅转录组中的CYPs和UGTs基因进行系统进化树分析,结合序列同源比对的方式筛选得到候选基因。根据候选基因序列,设计引物,以岗梅cDNA为模板扩增候选基因的功能区域(开放阅读框),进一步构建相应的克隆载体。对克隆得到的基因进行Sanger测序,利用生物软件分析并预测候选基因编码蛋白的理化性质,包括蛋白质的功能及其一级结构、二级结构和三级结构。  2.CYPs基因的真核表达和功能分析  构建CYPs基因的酵母表达载体,转化至高产α-amyrin的酿酒酵母WAT11tfAX菌株(本课题组构建,unpublished data)中,进行目的基因编码蛋白的酵母异源表达。利用Western blot技术检测目的蛋白质的表达,提取酵母代谢物,经衍生化后,运用GC-MS检测代谢产物,确认目的基因的功能。同时,构建带EGFP荧光标签的植物表达载体,将目的基因转化至烟草原生质体中,观测该基因的亚细胞定位。  3.UGTs基因的原核表达和功能分析  利用pET32a(+)E.coli原核表达体系,在E.coli Rossetta中表达UGTs,通过镍纯化柱后;分别以6种不同的三萜皂苷元和UDP-葡萄糖为底物,进行体外酶促反应。采用葡聚糖凝胶柱对酶促反应的产物进行分离纯化,然后采用MS和NMR对该产物进行结构鉴定,确定UGTs功能。通过蛋白质同源模拟和分子对接预测UGTs的关键活性位点,分析UGT可能的催化机制。类似的,利用EGFP荧光标签,检测其亚细胞定位。  4.外源三萜皂苷生物合成途径引入酿酒酵母  将岗梅三萜环化酶基因IaAS1与本研究中已鉴定功能的CYP和UGT,通过游离质粒导入S.cerevisiae WAT11tfAX中进行组合表达。同时,利用CRISPR/Cas9基因编辑法,将3个基因整合至WAT11tfAX基因组中,构建稳定菌株。利用LC/MS分析两种菌株的代谢产物。  5.岗梅基因组survey分析  提取岗梅基因组DNA,构建测序文库,用Illumina HiSeq平台测序,将测序得到的数据进行质量评估,拼接组装,用17-mer分析预测基因组大小、杂合度和重复率复杂程度。  结果:  1.获得比前期课题组更高质量的转录组数据,获得更多注释信息,茉莉酸甲酯诱导后岗梅转录组差异表达的基因未能找到与三萜皂苷相关的CYPs和UGTs基因,通过对转录组的深度挖掘分析筛选并克隆得到3个CYPs和5个UGTs的候选基因,并对其蛋白序列进行一级、二级、三级结构进行分析,为后续酶功能鉴定提供材料和理论参考。  2.岗梅IaCYP3010编码1个三萜皂苷C-28氧化酶基因。构建带HIS特异性标签的3个CYPs基因(IaCYP3010、IaCYP21058和IaCYP3769)的真核表达载体3个CYPs基因均能在S.cerevisiae WAT11tfAX)中成功表达。代谢产物的GC/MS检测结果表明,IaCYP3010为香树脂醇的C-28位氧化酶,催化α-amyrin生产熊果酸。该蛋白IaCYP3010定位为叶绿体。  3.IaUGT317编码1个三萜皂苷C-28糖基转移酶。克隆并成功表达5个UGTs。酶促反应结果显示,IaUGT317能够催化熊果酸、冬青素A、常春藤皂苷元生成新的化合物。扩大以熊果酸为底物的酶反应体系,将产物进行分离纯化之后进行QTOF和NMR分析,确定产物为28-O-β-D-吡喃葡萄糖熊果酸酯,确证IaUGT317的糖基化催化位点为C-28。亚细胞定位实验结果显示,该蛋白定位于细胞质。  4.成功在酿酒酵母中构建岗梅三萜生物合成途径。分别用游离质粒转化法和基因编辑法将OSC基因IaOSC1、C-28位氧化酶基因IaCYP3010和C-28位糖基转移酶基因IaUGT317引入S.cerevisiae WAT11tfAX)中,成功鉴定到目标产物28-O-β-D-吡喃葡萄糖熊果酸酯。  6.获得岗梅基因组测序数据23.5Gb,测序深度为29.72×;通过17-mer分析预估的基因组大小为790.3Mb,杂合度为1.06%,重复序列比例为52.39%;由各项分析可以得出岗梅的基因组为高复杂基因组。  结论:  本研究成功鉴定了岗梅三萜皂苷生物合成下游途径中1个CYP氧化酶基因和1个UGT糖基转移酶基因,并成功将合成熊果烷型三萜皂苷的外源途径导入S.cerevisiae中,获得了熊果酸和28-O-β-D-吡喃葡萄糖熊果酸酯。研究结果为后续进一步发掘岗梅生物合成相关CYPs和UGTs,以及开展岗梅三萜皂苷的合成生物学研究奠定了重要基础。
其他文献
中国历史五千年文化发展的长廊中,出现了各种各样的文学作品,对后世有着深远的影响。我们根据作者的创作意图可以揣测文章所要表达的中心思想和作者当时的写作场景,从而提高自身
以XI-Plus框架为工具,以知识为基础的锚杆支护设计与选型专家系统的建立,使得计算机运用知识、经验和信息进行推理判断成为可能,从而为地下矿山锚杆支护设计与选型提供了一种经济实用的
空间映射的思想是通过构造粗糙模犁设计变量与精确模型设计变量之间的映射关系,获得合适的替代模型(校准后的粗糙模型),从而简化优化过程。本文针对电容耦合式RFMEMS开关使用初始空间映射算法进行计算和优化,经过迭代,建立了精确空间和粗糙空间的映射关系,最终得到了精确空间优化设计值,利用此映射关系,可将精确空间的优化工作放到粗糙空间进行,从而大大节省时间和电脑资源。计算结果验证了该方法的可行性和高效性。
目的:观察β-榄香烯对体外微管蛋白聚合与解聚的影响及抗肿瘤疗效。方法:通过浊度法测定β-榄香烯对提取牛脑微管蛋白聚合的影响。以紫杉醇、长春新碱为阳性对照,溶剂DMSO为空白对照。用不同浓度的药物培养细胞,不同的时点在电镜下观察药物对细胞微管形态,排列以及通过MTT法对肿瘤细胞存活率的影响。实验结果表明:①β-榄香烯五个剂量组对体外微管蛋白聚合的最大抑制率分别为5.8%、15.7%、26.5%、53
目的:对"怡神颗粒"按研究新药标准进行药学研究,选择合适的剂型,制定制剂工艺,同时进行药效学研究,探索药理作用机制,并初步建立制剂质量标准,为申报新药打下基础,以期发挥应
该文第一章介绍了千金定志胶囊的研究概况,从传统中医药理论到现代医学理论探讨了千金定志胶囊的健脑益智的作用机理.千金定志胶囊是由传统中药复方定志小丸,运用现代科学技
目的:该研究应用《苏沈良方》冰片萝卜汁治头痛方的基础上,去萝卜汁,加吴茱萸而成.在制剂过程中,将吴茱萸利用水提醇沉法,提取有效成分,最大限度的保持了吴茱萸原药材的功效.
该研究系统总结了当归四逆加吴茱萸生姜汤(DYJ)的临床应用实践和最新理论研究成果,探讨了其药理作用和组方原理,并与当归四逆汤比较各自特点和差异,得到了一些有意义的结果.论
露天矿代化设计的实质是以计算机为基础去实施一种适用于矿体三维块段模拟的算法。勒奇斯和格罗斯曼于1965年发表的第一个计算机算法开创了运筹学在矿业中应用的一个最为活跃
2004年6月10日,井上厦、梅原猛、大江健三郎、小田实、奥平康弘、加藤周一、泽池久枝、鹤见俊辅、三木睦子共九人结成“九条会”,并于当天举行了新闻发布会。在战后数十年的