MIR--1266在肝细胞癌中的表达及其生物学行为研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jianghong_jones
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:  肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC,简称肝癌)是我国常见的恶性肿瘤之一,起病隐匿、病程短、死亡率高。HCC的发生发展的分子机制复杂且尚未完全清楚,相关研究发现miRNA参与HCC生物学行为,促进HCC的发生发展。本研究前期通过公共数据库筛选肝癌差异表达的miR-1266及其靶基因ATG7,在人群肝癌组织中验证miR-1266、ATG7,在HepG2细胞株中构建miR-1266过表达和抑制表达,探讨miR-1266对肝癌细胞增殖、细胞周期、细胞凋亡等生物学行为的影响。为肝癌的早期诊断和靶向治疗提供理论依据。  方法:  1.生物信息学分析:(1)下载TCGA数据库(the Cancer Genome Atlas)肝癌基因表达数据,筛选差异表达miRNA,再经检索文献,选择尚未在肝细胞癌中报道且参与肿瘤相关生物学功能的miR-1266作为本研究的候选基因;(2)应用miRNA靶基因预测网站(TargetScan、RNA22、miRwalk、miRtarbase)预测miR-1266的候选靶基因,再利用TCGA数据库分析miR-1266和候选mRNA的相关性,将负相关的作为miR-1266的候选靶基因。经文献检索,本研究选择ATG7作为miR-1266候选靶基因进行研究;(3)下载TCGA数据库的肝癌患者临床信息数据,分析miR-1266和肝癌患者临床病理特征关系,并采用Kaplan-Meier法分析miR-1266对肝癌预后的影响。  2.在人群肝癌组织中验证基因表达:收集广西医科大学附属肿瘤医院HCC患者的肝癌组织及配对癌旁组织60对,并收集患者的临床病理相关信息。实时荧光定量PCR方法检测肝癌组织及配对癌旁组织样本中miR-1266和ATG7的表达,分析miR-1266和ATG7的相关性及miR-1266、ATG7与临床病理特征的关系。  3.在肝癌细胞株中验证基因表达:在上海中科院细胞所购买6株(BEL-7404、SK-HEP-1、SMCC-7721、Hep3B、Huh7、HepG2)肝癌细胞株,用实时荧光定量PCR检测6株肝癌细胞株miR-1266表达。对HepG2细胞构建过表达和抑制表达体系,同时检测miR-1266和ATG7的表达。  4.细胞功能实验:对HepG2细胞构建过表达和抑制表达体系,进行细胞增殖实验、细胞周期实验、细胞凋亡实验,探讨miR-1266对肝癌细胞HepG2生物学行为的影响。  结果:  1.生物信息学分析显示:(1)TCGA数据库共提供377个HCC患者的数据,平均年龄59岁,其中209例临床数据与基因表达数据完整且匹配。对377例肝癌组织和50例癌旁组织进行测序,50例癌旁组织均来源于377例肝癌组织。(2)共筛出98个差异的miRNA,其中27个上调,71个下调,基于文献检索后,选择尚未在肝细胞癌中报道且参与肿瘤相关功能的miR-1266作为本研究的候选基因。(3)4个miRNA靶基因预测网站取交集共筛出60个mRNA,其中GRINA、PCSK2、RAB15、PTDSS2、EIF5AL1、MUTYH、ATG7与miR-1266呈负相关(P<0.05),经文献检索,本研究选择ATG7作为miR-1266的候选靶基因。(4)miR-1266与临床病理特征的关系:miR-1266的表达水平与肿瘤分级、甲胎蛋白(Alpha fetoprotein,AFP)、年龄分布差异有统计学意义(P<0.05),而性别、家族史、有无HBsAg感染、MVI(Microvascular invasion)、肿瘤状态、T分期及生存状态分布差异无统计学意义(P>0.05)。(5)Kaplan-Meier法分析显示,miR-1266表达水平与HCC生存时间无统计学关联(P>0.05)。  2.人群肝癌样本基因表达分析结果显示:(1)miR-1266在肝癌组织中的表达水平高于癌旁组织(t=3.402,P=0.001),ATG7在肝癌组织中的表达水平低于癌旁组织(t=-2.44,P=0.019);(2)miR-1266在肝癌组织中与ATG7呈负相关(r=-0.324,P=0.023);(3)miR-1266的表达水平在肿瘤分化程度、甲胎蛋白(Alpha fetoprotein,AFP)分布差异有统计学意义(P<0.05),而性别、年龄、职业、有无门脉高压、有无家族史、有无HBsAg感染、肿瘤大小、MVI(Microvascular invasion)、有无包膜侵犯、有无肝外转移、有无腹水、巴塞罗那(BCLC)分期、有无门脉癌栓等分布差异无统计学(P>0.05)。(4)ATG7的表达水平在肿瘤大小、巴塞罗那(BCLC)分期分布差异有统计学意义(P<0.05),而性别、年龄、职业、有无门脉高压、有无家族史、有无HBsAg感染、肿瘤分化程度、AFP、MVI(Microvascular invasion)、有无包膜侵犯、有无肝外转移、有无腹水、有无门脉癌栓等分布差异无统计学意义(P>0.05)。  3.肝癌细胞株基因表达分析结果显示:(1)miR-1266在BEL-7404、SK-HEP-1及SMCC-7721细胞中低表达,在Hep3B、Huh7及HepG2细胞中表达较高。由于miR-1266在HepG2细胞中表达最高,因此,选择HepG2细胞进行后续的实验。(2)miR-1266过表达组中miR-1266表达丰度是阴性对照组的417.78倍,miR-1266抑制表达组中miR-1266表达丰度是阴性对照组的0.79倍。(3)过表达miR-1266,ATG7表达下降(P<0.05),而抑制表达miR-1266,ATG7的表达变化差异无统计学意义(P>0.05)。  4.细胞功能实验:(1)CCK8细胞增殖实验结果显示:miR-1266过表达组细胞增殖能力增强(P<0.05),而miR-1266抑制表达组的增值能力被抑制(P<0.05)。(2)细胞周期实验结果显示:miR-1266过表达组处于S期的细胞增多(P<0.05),处于G1期的细胞无显著变化(P>0.05),处于G2/M期的细胞减少(P<0.05);miR-1266抑制表达组处于G1期、S期的细胞无显著变化(P>0.05),处于G2/M期的细胞增多(P<0.05)。(3)细胞凋亡实验结果显示:miR-1266过表达组对肝癌细胞的凋亡能力高于对照组(P<0.05),但实际凋亡率变化不明显;miR-1266抑制表达组对肝癌细胞的凋亡能力无影响(P>0.05)。  结论:  1.miR-1266在肝癌组织中表达上调,ATG7在肝癌组织中表达下调;2.miR-1266、ATG7与肝癌临床病理特征相关;3.miR-1266在肝癌组织和HepG2细胞中的表达水平与ATG7呈负相关;4.miR-1266过表达和抑制表达影响肝细胞癌的增值、细胞周期,提示miR-1266可能通过调控ATG7的表达促进肝癌的生物学行为。
其他文献
在大地之上,你向南飞,或者向西,速度使千山万水长如一本杂志或两份报纸,你从一个城市抵达另一个城市,从楼群、商场、白色马赛克和蓝色玻璃幕墙抵达楼群、商场、白色马赛克和
8月31日至榆林,榆林文联的霍文多、李严陪我们看镇北台,到水库游泳.塞上秋深,水很凉.rn陕北之行主要考察了榆林地区的佳县、米脂和绥德.rn
多年来的试验结果一致证明,对淮南、淮北的低产麦田实行氮、磷素肥料配合使用的施肥方法,确实能迅速提高小麦产量.肥西县园林公社瘠薄麦田采用氮、磷素肥料配合施用,小麦单
改进了杂交水稻器官发生的再生植株的炼苗方法。采用两步炼苗法再将植株直接移栽入土,可使移栽成活率超过80%。观察了温室条件下成活的体细胞再生植株的生长、发育及结实情况
经理叫我去他办公室,让我看一封信.从信封上看是荻寄于一家外商的,但里边却装着一封写给他的恋人莉的信.经理说,请你负责对这件事作出解释和处理.rn
整个夏天,我和郭红在一起.rn一吃过午饭,郭红就来叫我.每次她都不进来,站在小伙房外,脸贴在窗上,鼻尖和脸蛋挤压成一个平面,敲窗,招手.rn这时,我总是以最轻快的动作跑出来,一
目的:  评价超声引导下腹横肌平面神经阻滞麻醉用于婴幼儿腹股沟区短小手术的麻醉效果、安全性及其术后持续镇痛效果。  方法:  经郑州市儿童医院伦理委员会批准,选择ASA
人人都能取得平均投资表现—只需投资一个每样都买一点儿的指数基金即可,这会带给你所谓的“市场收益”—仅与市场表现相当。但是成功的投资者想要的更多,他们希望战胜市场。
都说原种场的人穷,穷人也有穷的活法.大仙就是一个有自己活法的女人.大仙姓啥,人们已经忘了,男人死得又早,场里的人就随着习惯叫她大仙.大仙带着女儿水仙过日子,守着空旷的偌
酒令官者何许人也?是专司酒令的差事.只要酒令官居中而坐,将筷子在碗上“当当当”敲三下,犹如明镜高悬下的大老爷拍响了惊堂木,威风凛凛,说一不二;又好像指挥三军的大元帅敲