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鸭沙门氏菌病又名鸭副伤寒,传播速度快,雏鸭死亡率高,成年鸭常呈隐性经过,成为主要传播源之一。近些年,沙门氏菌病成为一种重要细菌病,给养鸭业造成严重经济损失。在防治该病过程中,因为抗生素的不合理使用,引发沙门氏菌的耐药性增强,甚至出现多重耐药。本研究首先应用选择培养基、PCR和生化鉴定等方法对从河南和浙江地区部分鸭场采集到的220份粪便样品进行鸭源沙门氏菌的分离鉴定,对分离到的菌株进行血清型分型和药敏试验分析,然后选择流行率较高的菌株进行致病性试验,从中鉴定获得致病性菌株,并对其进行基因组测序,分析其携带的抗性基因、前噬菌体序列等,从而探讨鸭源沙门氏菌可能的耐药机制和临床防治策略。研究结果表明,通过选择培养基、PCR和生化鉴定等方法分离到18株鸭源沙门氏菌。血清型检测发现,18株鸭源沙门氏菌分属于4种血清型,其中印第安纳沙门氏菌14株、图莫迪沙门氏菌1株、阿贡纳沙门氏菌1株、阿尔顿道府沙门氏菌2株。药敏试验结果显示,这些鸭源沙门氏菌分离株对多西环素的敏感性很高,适合用于临床治疗。但对头孢哌酮、四环素、诺氟沙星、吡哌酸、甲氧苄胺嘧啶耐药率较高,达75%,其中15株出现多重耐药现象。动物致病性试验结果表明,印第安纳沙门氏菌47号分离株半数致死量为1.553×10~8,雏鸭感染鸭源沙门氏菌后,表现出明显的沙门氏菌感染症状,肝、心、脾均有一定病理变化,尤以肝损伤更典型,从中获得致病性菌株SAP。根据致病菌株SAP基因组测序结果,从NR库中注释得到10个抗性基因、CARD库中得到10个抗性基因簇和分析得到五条前噬菌体相关的插入序列,其携带的抗性基因分别为:氟喹诺酮类抗性基因gyr B,磷霉素抗性基因glp T、Uhp A和Uhp T,头孢菌素抗性基因bla SPG-1,肽类抗生素抗性基因van RI,以及介导大环内酯类、头孢菌素、四环素类、氨基糖苷类、喹诺酮类、二氨基嘧啶类等耐药的MFS外排泵家族基因Aba F和Aba Q,R ND外排泵家族基因ade L和CRP。五条前噬菌体相关的插入序列与沙门氏菌噬菌体e psilon 34和沙门氏菌噬菌体SJ46相似度极高,epsilon 34的gtr ABC基因簇与宿主菌血清型有关,SJ46噬菌体携带的bla CTX-M-27耐药基因可垂直和水平传播。综上所述,从浙江和河南部分地区分离鉴定出18株鸭源沙门氏菌,分属于4种血清型,表现出对多种抗生素类药物的耐药,而这些耐药现象与其所携带抗性基因和基因簇有一定相关性,这些试验结果将为进一步探讨致病性沙门氏菌的致病机理及耐药机制奠定理论基础,也有望为这些地区沙门氏菌的防治提供理论依据。