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采用机械打磨处理贝壳样品，并采用电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)法测定常见珍珠贝贝壳中二十种元素，Mg、Al、Ti、V、Cr、Fe、Mn、Co、Ni、Cu、Zn、Ge、As、Sr、Mo、Cd、Ba、La、Ce和Pb的含量，并对测定的结果进行主成分分析、聚类分析和元素含量差异比较。
一、在马氏珠母贝2x2双列杂交组合(II、IS、SI和SS)贝壳中，Sr，Mg，Fe，Mn，Zn，Ni含量高，V含量甚微。用元素含量的变异系数表示不同组贝壳元素含量的相对离散度，表明Al，Ti，Cr，Zn的含量变异较大，Mg，V，Mn，Co，Ni，Sr，Cd，La，La，Ce含量较稳定。四个杂交组合的元素含量差异反映了具有不同遗传背景的杂交组合对元素的吸收和富集的差异，说明马氏珠母贝对富集元素的能力与遗传因素直接相关。通过主成分分析，主成分1:As、Ba、Al、Ge、Cr、Ce、Zn.、CA和La的影响最大;主成分2:Mn，Mg，Cu，Ti、Sr、Ni和Mo影响较大。杂交组合(IS和SI)距离较近，首先聚合在一起，然后再与Ⅱ组聚合在一起，最后与SS组聚合在一起。2个杂交组合的元素含量接近，两个杂交组合的元素含量偏向作为亲本之一的II，与另一个亲本SS差距比较大。这个结果与使用微卫星分子标记得到的结果是一致的；
二、通过将马氏珠母贝优良品系“海优1号”在不同海域养殖后的贝壳元素分析表明，Sr、Mg、Fe、Ni和Mn含量较高，其它元素含量较小。在不同养殖海域，Al、Ti、Zn、Ge的含量变化较大，Mg、Mn、Co、Ni、sr、Cd、Pb的含量比较稳定；环境因素对贝壳的元素含量影响较大。通过主成分分析，主成分1:正向作用的元素及强弱顺序:Pb＞Ni＞V＞Co＞Sr＞As＞Ba＞Fe＞Mo＞Ti＞Mg＞Cr;负向作用的元素及强弱顺序：Ge＞Al＞Mn＞Zn＞Cu＞Cd＞La＞Ce。主成分2：正向作用的元素及强弱顺序：Pb＞Ce＞La＞Mn＞Zn＞Ti＞Fe＞Co＞V＞As＞Ni;负向作用的元素及强弱顺序:Mg＞Al＞Cu＞Cd＞Ba＞Sr＞Mo＞Ge＞Cr。主成分3：正向作用元素及强弱顺序：Cr＞Mo＞Cu＞La＞Al＞Mg＞Pb＞Fe＞Ce＞Zn＞Co＞V；负向作用元素及强弱顺序：Cd＞Ti＞As＞Ba＞Sr＞Ni＞Ge＞Mn。Cr、Cd、Ti、Mo、Cu对主成分的影响较大。聚类分析表明，养殖在广东雷州英利镇英良村养殖和YPL广西北海铁山港营盘镇当地养殖“海优1号”贝壳元素含量接近，与养殖在海南陵水县黎安镇黎安港海域的“海优1号”贝壳元素不相同；
三、在7种珍珠贝的贝壳元素中，Sr、Mg、Fe、，Mn含量较高，As含量最低，其中Al、Ti、Ge、As、Ba含量变化大：Mo的含量变化最小。在主成分分析中，主成分1:呈正向作用的元素主要有Co、Cd、Sr、Mg，呈负向作用的元素主要有As，Cr、Mn;主成分2；呈正向作用的元素主要有Cr，V，Ni，呈负向作用的元素主要有Mn，Ge，Pb;主成分3:呈正向作用的元素主要有Zn，La，Ce，V，Cr，呈负向作用的元素主要有Mg;主成分4：呈正向作用的元素主要有As，Pb，Al，呈负向作用的元素主要有Fe。聚类分析表明，企鹅珍珠贝与斑珠母贝首先聚在一起，再与大珠母贝汇聚，与解氏珠母贝和黑珠母贝聚合的一支汇合，最后与马氏珠母灵与珠母贝聚合的一支结合。此结果与分子标记的聚类结果不一致，主要原因可以是取样的地点不一样，环境因子极大地影响不同珍珠贝贝壳元素含量。依此作为系统分类的标准需要慎重。
四、从整个试验分析的珍珠贝贝壳元素含量表明，印度-三亚贝杂交系列凡在海南陵水黎安港养殖至成贝后其贝壳中铅(Pb)和砷(As)元素含量上都高于“我国食品卫生法对食晶中有害元素含量的规定”。而本试验中采用的7种珠母贝以及马氏珠母贝-海优一号在广西北海和广东雷州养殖后其贝壳中铅(Pb)和砷(As)元素含量上均低于我国食品卫生法对食品中有害元素含量的规定”，说明这类贝的贝壳均适合作为食品或食品添加剂。