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受到西方治理理论和高等教育改革的影响，在新的政治经济环境压力下，台湾地区公立大学校长的产生方式在上世纪90年代开始发生了重要的变化，这种变化最重要的特征就是治理理念在大学的选聘过程中得到了充分地体现。大学校长的产生由过去完全通过教育行政主管部门任命转变为由大学自主组织具有广泛性的遴选委员会，通过公开、透明和有效互动的方式遴选校长。通过台湾地区五所公立大学——台湾大学、阳明大学、暨南国际大学、交通大学、清华大学的实证分析，剖析了当前台湾地区在经过了20多年校长遴选改革后的基本现状和特征。这些特征总体上可以概括为几个方面：治理主体的多元性，这点主要从校长遴选委员会的组成可以得到充分地体现；治理过程的参与性，让相关人员充分地参与到遴选过程，通过有效地协商、互动和沟通来实现共同意志的有效达成；结果监督的社会评价，让社会第三方机构有效地参与校长的评价和监督中来。当然，台湾地区公立大学校长的遴选也存在着一些问题和困境，甚至存在一些争议，这需要在未来的改革中不断地加以完善。针对这些问题，论文提出了一些有针对性的建议和对策。尽管两岸大学制度存在着很大的不同，但是，台湾地区公立大学的校长遴选依然可以为大学校长的遴选和中国特色现代大学制度建设提供某些有益的启示。论文从治理的视角对两岸公立大学校长遴选机制进行比较，基于大陆目前大学校长遴选机制存在的问题，提出理性定位大学校长角色，制定科学合理的遴选标准、程序以及管办评分离，第三方参与校长遴选过程给大陆地区校长遴选提供借鉴的经验和启示。