依赖型葡萄糖脱氢酶的研究

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葡萄糖脱氢酶由于具有活性高和双辅酶特异性等优点,在辅酶再生领域具有广阔的应用前景。我们首先从若干株芽孢杆菌及其近缘种中克隆到若干个葡萄糖脱氢酶基因,选择出其中活性最高的来源于Lysinibacillus sphaericus G10中的葡萄糖脱氢酶(LsGDH)进行深入研究。对重组LsGDH进行了酶学性质和耐碱性机制的研究;通过理性设计得到了稳定性显著提高的突变体;并发明了直接从土壤宏基因组中一步克隆葡萄糖脱氢酶全长序列的方法。论文的主要研究结果如下:   1) LsGDH基因的克隆、表达与性质研究   利用简并PCR和染色体步移从L.sphaericus G10中克隆到葡萄糖脱氢酶基因全序列。该基因大小为786 bp,编码262个氨基酸。重组LsGDH在250C活性为205.7士6.9 U/rag。经SDS-PAGE和排阻层析,确定LsGDH为同源四聚体。该酶的最适温度和最适pH分别是500C和9.5;其热稳定性较差,只在350C以下稳定;但是该酶的耐碱性较好,在pH6.5-10.5之间稳定。LsGDH在直链烷醇中的稳定性可以用Gaussian分布模型来描述(R≥0.94)。   2) LsGDH耐碱机制的初步探讨   通过将理论分析和功能实验相结合,从分子的角度初步阐明了LsGDH的耐碱机制。定点突变研究结果表明,第170位的氨基酸类型对于葡萄糖脱氢酶的pH稳定性起到了至关重要的作用,第114位的氨基酸对其稳定性有一定贡献,约为20%。对LsGDH由单体形成四聚体过程中的静电相互作用能和疏水相互作用能的变化分析结果表明,影响LsGDH四聚体在碱性pH下稳定的主要因素是静电相互作用,而非亚基间疏水相互作用。   3)通过理性设计提高LsGDH的热稳定性   通过对LsGDH经同源建模后的三维结构分析,结合定点突变技术,在LsGDH四聚体AC和BD亚基间各引入一对二碗键,获得了一株热稳定性显著提高的突变体DS255。DS255经亲和层析纯化过柱过程中有约60%蛋白被空气氧化形成二硫键,在4℃放置一周后经空气自然氧化后几乎全部蛋白都形成二硫键。DS255的Tm值为86.7℃,比野生型提高了40.5℃。DS255对于底物和辅酶亲和力下降了3倍左右,但是其kcat则提高了50%左右,而可溶性表达量尽管降低,但仍比较可观。这说明我们通过在LsGDH四聚体亚基间引入二硫键提高其热稳定性的策略是成功的,极大的提升了LsGDH的实用价值。   4)从土壤宏基因组中一步克隆葡萄糖脱氢酶的方法   发明了从土壤宏基因组中通过一步PCR方法扩增出葡萄糖脱氢酶全长序列的方法。对扩增条件的研究结果表明,土壤基因组的纯度和复杂性对能否成功扩增出目的基因至关重要。此外,用于扩增的引物简并性要尽量低且待扩增DNA片段长度尽量小于2kb,目标片段越小,扩增效率越高。该方法省却了后续繁琐的染色体步移的步骤,由该方法克隆出的DNA片段混合物,可不经测序直接用于DNA改组介导的蛋白质定向进化,由于土壤微生物的多样性导致所获得片段的多样性,因而筛选到目的性状的成功率也大为提高。
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