由丙型肝炎病毒临床分离株直接构建丙型肝炎病毒细胞感染模型的研究

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丙型肝炎病毒(hepatitisCvirus,HCV)属于黄病毒科,是有包膜的单股正链RNA病毒,其基因组长9.6kb,根据序列同源性至少可划分为6个基因型以及很多的亚型和分离株。基因型之间不仅存在序列差异,而且对抗病毒治疗的应答也不同。基因型1b和2a是中国丙型肝炎患者中最常见的基因型。  HCV的体外培养模型对研究HCV生命周期及抗病毒药物开发非常重要。由于患者血清不能感染Huh7来源细胞系,体外培养HCV必须得制备感染性cDNA克隆。基于JFH-1或嵌合体J6/JFH-1的真病毒细胞感染模型于2005年构建成功,随后来源于其它基因型的5UTR-NS2、NS3/NS4A或NS5A与JFH-1的嵌合病毒也相继被报道。最近,通过对共有序列的克隆引入适应性突变,科学家们已经建立了1a型的TN株、2a型的JFH-2和J6、2b型的J8、DH8和DH10株的高效感染性克隆。这些研究几乎全部是基于实验室已优化过的原型株,而直接来自于临床病毒株的全长或者嵌合HCV细胞培养模型鲜有报道。  在第一部分的工作中,为了研究从临床病毒株直接构建重组HCV病毒的可能性,我们选择了三例中国基因型1b丙型肝炎患者血清样品,从中扩增了从Core到NS2的第一个跨膜结构域,与JFH-1的基因组融合后,通过克隆筛选策略,我们一共得到4个克隆,能在Huh7.5.1细胞中产生感染性病毒。长期传代得到的病毒在1b基因型来源的区域发生的适应性突变能有效增加病毒感染力。以E2蛋白的单克隆抗体及原始患者血清对上述病毒做中和实验,发现其中三株病毒(26C3mt,52B6mt和79L9)可以被有效中和,而26C6mt对中和抗体几无反应。这些临床来源的病毒不仅可以在毒株特异性的水平上用于研究Core-NS2的功能,筛选中和抗体,而且对我们理解病毒的组装与释放等各方面都很有帮助。  在第二部分的工作中,我们将克隆筛选策略扩展到HCV的全基因组,通过对一例基因型2a患者血清(PR63)体外培养中有功能片段的组合及在细胞内的适应,构建了来源于中国丙型肝炎患者血清的第一个全长感染性cDNA克隆。我们首先逐段筛选并验证了PR63来源的Core-NS3、NS3-NS5A及NS5B片段在JFH-1骨架上可以有效地进行体外培养并产生病毒,然后通过对有功能片段的组合及进一步筛选、优化,得到了全长的PR63感染性克隆PR63cc。PR63cc可以在Huh7来源的肝细胞系中高效扩增,最高感染性滴度可达1.6×105ffu/mL;PR63cc可以被E2抗体中和,也可以被我们所测试的几个抗病毒药物抑制;与JFH-1相比,PR63cc对NS5A的抑制剂Daclatasvir高度不敏感。我们开发的这种构建HCV全长感染性克隆的方法,不仅能应用于其他临床分离株,还可能为今后丙型肝炎患者的个性化治疗带来便利。
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