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目的：检测新疆哈萨克族食管鳞癌、癌旁非癌组织和正常食管粘膜中miR-203基因的甲基化状态,探讨miR-203基因甲基化与食管鳞癌之间的关系及其意义。方法：运用基质辅助激光解析电离时间飞行质谱仪（MALDI-TOF MS）检测99例新疆哈萨克族食管鳞癌、46例癌旁非癌组织和46例正常食管粘膜中miR-203基因甲基化状态。运用Cluster 3.0软件、TreeView软件对三组样本miR-203基因甲基化数据进行分层聚类分析。运用GraphPad Prism 5软件对三组样本miR-203基因甲基化数据进行分布状况分析。运用SPSS16.0软件对食管鳞癌/癌旁非癌组织/正常食管粘膜三组样本、ESCC临床病理学特征、HPV16感染间miR-203基因甲基化数据进行非参数秩和检验统计学分析。结果：1、食管鳞癌、癌旁非癌组织和正常食管粘膜三组miR-20315甲基化数据比较结果：新疆哈萨克族鳞癌、癌旁非癌组织中miR-20315呈高甲基化改变,且miR-20315有10个CpG单位（CpG7.8、CpG10、CpG11、CpG12、CpG14、CpG15.16、CpG17.18.19.20、CpG22.23、CpG24、CpG31.32）的高甲基化改变与新疆哈萨克族食管鳞癌的发生相关（p<0.05）；而miR-20315有两个CpG单位（CpG10、CpG11）在食管鳞癌与癌旁非癌组织之间存在甲基化水平的差异（p<0.017）,且这两个CpG单位的甲基化水平在癌旁非癌组织中较高。2、miR-20315甲基化与食管鳞癌临床病理学特征比较结果：与性别比较,miR-20315各CpG单位甲基化水平在两组间无差异性（p>0.05）；与年龄相关性分析显示,CpG22.23甲基化水平与年龄呈止相关（p<0.05）：与肿瘤发生部位比较,CpG 31.32甲基化水平在不同部位间存在差异性（p<0.05）,且甲基化率比较：下段>中段>上段；与肿瘤大体类型比较,CpG24甲基化水平在不同类型间存在差异性（p<0.05）；与肿瘤分化程度比较,CpG17.18.19.20甲基化水平在高、中、低分化程度间存在差异性（p<0.05）且甲基化率比较：中分化组>高分化组>低分化组；与淋巴结转移、TNM分期（Ⅰ期+Ⅱ期和Ⅲ期+Ⅳ期）比较,均无甲基化水平的差异性（p>0.05）。3、miR-20315甲基化与食管鳞癌HPV16感染比较结果：CpG15.16、CpG17.18.19.20在HPV16（+）组与HPV16（-）组之间存在甲基化水平差异性（p<0.05）,且甲基化率比较：感染组>非感染组。结论：1、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌与癌旁非癌组织miR-20315甲基化水平显著高于正常食管粘膜。2、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌miR-20315有10个CpG单位（CpG7.8、CpG10、CpG11、CpG12、CpG14、CpG15.16、CpG17.18.19.20、CpG22.23、CpG24、CpG31.32）呈高甲基化改变,这种改变可能是新疆哈萨克族食管鳞癌发生的一个早期事件。3、新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌miR-20315有两个CpG单位（CpG15.16、CpG17.18.19.20）高甲基化改变与HPV16感染相关,两者可能协同作用共同参与新疆哈萨克族食管鳞状细胞癌的发生、发展。