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西溪湿地是我国仅有的一处被列入国际重要湿地名录中的城市性湿地。原生动物群落特征与水环境质量变化关系以及原生动物可作为检测水质的指示生物方面的研究是目前国际上高度关注的焦点之一。近年来，对湖泊，河流等的研究已相对成熟，但对城市湿地生态系统的研究不多见。为揭示原生动物群落的周年变动以及与城市湿地水质方面的关系，本文自2012年5月-2013年4月，对杭州西溪湿地进行了为期一年的调查。结果共发现89种原生动物，其中纤毛虫34种，鞭毛虫13种，肉足虫42种，共有7个优势种，分别为旋回侠盗虫，粗尾滴虫，简裸口虫，大弹跳虫，王氏似铃壳虫，瓶砂壳虫，陀螺侠盗虫。原生动物群落丰度的周年变动范围在3×104 ind.1-1 to19.65×104 ind.1-1，属富营养化水体，纤毛虫的贡献率最大（占69.28％），可见纤毛虫对富营养化状态起到了重要的作用。聚类分析结果显示明显的季节性，在30％相似性水平上，将原生动物群落分为三组（冬季，春季，夏秋季）。Spearman相关分析显示，原生动物群落的周年变动与环境因子的变动显著相关，特别是与水温，溶解氧，化学需氧量，生化需氧量和总氮。多元相关分析显示，原生动物群落的变动不只是受单一因子的控制，而是受环境因子的综合影响，其中相关性最高的是水温，pH，溶解氧，化学需氧量和总磷的组合（R=0.539，P＜0.01）。三个多样性指数（物种丰富度，多样性，均匀度）与化学需氧量和营养因子显著相关。综合分析，原生动物群落丰度的周年变动显示了一个清晰的季节变化，并且与环境因子的变动显著相关，因此，原生动物在湿地环境系统可作为潜在的指示性生物用于检测相应水域水质环境的现状。