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大型底栖无脊椎动物（Marcobenthos）广泛地分布于河流生态系统中，其生长、繁殖、群落演替和群落结构的变化与水环境因子（包括水文特征、理化指标、河床条件、河岸类型等）关系密切，又因其寿命相对较长，且迁移能力有限，便于采集，所以对大型底栖无脊椎动物的研究成为评价河流生态环境的关键内容。东江是典型亚热带气候下的高功能型河流。生物的分布和生态系统特征具有很强的地域性，我国对这类河流的底栖动物研究缺乏全面系统地数据积累。探明大型底栖无脊椎动物群落的分布状况，无论对于河流生态学的理论研究还是实际应用都非常必要，特别是对于保护河流生物多样性方面更有必要。因此本研究从调查大型底栖无脊椎动物的群落分布特征入手，确定不同河段的物种分布，以及大型底栖无脊椎动物群落结构从上游到下游随生境的改变而发生的响应变化。其除此之外，还需兼顾物种组成的特征变化及其生物与生境之间的交互作用，力求依据在不同河段底栖动物多样性指数及群落功能特征的变化特点，可以探明受损河道的生物表征。本文通过对东江的大型底栖无脊椎动物和水体环境进行全面的调查，开展了亚热带地区河流底栖动物群落结构调查与生态环境指示评价研究，结果如下：（1）2012年对东江底栖动物调查共获得117个大型底栖无脊椎动物分类单元，主要由环节动物、水生昆虫、软体动物组成，隶属于4门8纲20目54科102属。主要包括软体动物18科17属32种；蛭纲2科4属；甲壳纲2科2属；昆虫纲6目32科79属。（2）东江底栖动物平均生物量为63.75g/m~2，平均密度为3214ind/m~2。底栖动物各类群的生物量和密度差别明显，东江干流的中上游的生物量较高，而下游至河口河段的平均密度较大，这是因为中上游河段软体动物生物量所占比例最高，为92.3％。软体动物个体较大，常附有较重的角质壳，是生物量的主要贡献者，因此上、中游河段生物量相对较高；下游河段尽管寡毛类密度很高但生物量较小，物种密度中寡毛类所占比例最高，为90.8%。（3）经生物指数与理化因子作相关性分析后发现，溶解氧、透明度、流速、电导率是影响东江大型底栖无脊椎动物种类组成与分布的主要环境因子。BI指数、Shannon-Wiener多样性指数和透明度均呈极显著正相关关系，与流速和电导率呈极显著负相关关系。说明溶氧高透明度高的清洁水域，底栖动物的生物多样性高；流速大电导率高的水域底栖动物物种相对单一，特定环境影响着底栖动物的分布，通过底栖动物的调查又能反映该地区的环境现状充分体现物种与环境之间的响应。（4）根据香农指数与BI指数对东江河段的评价，东江源头地区环境较为清洁，个别河段随着受到人为干扰强度的加强，指示水质情况变差，BI指数相较于多样性指数能更好的反映栖息地的相关情况。东江水质整体来看上游地区的评价结果好于中下游，19个清洁位点多集中在上游支流，BI指数评价时仅有两个点出现在下游地区，而多样性指数评价更注重多单个物种丰度的考量，因此在下游没有评出清洁位点；在下游中污、重污位点多，分别占整个监测位点的36%和25%；近河口处的部分支流甚至出现严重污染的位点，所占比例为5%。