海南长寿人群单核苷酸多态性及表达数量性状位点研究

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人口老龄化是目前中国乃至全球十分严峻的问题,随着老龄人口的不断增加,中国的社会人口比例发生了巨大的变化,给社会生产力和社会活力带来了严重的影响,长期患病的老年人群给社会医疗和子女们带来了严重的负担。因此人口老龄化问题是一个关乎国计民生、亟需解决的重大问题。长寿老人作为人类健康衰老的典范,他们能延缓甚至规避很多老年疾病,有较低的住院率和较少的住院时间,能健康地老去。因此对长寿人群这个天然的模型进行研究将会为人们认识长寿、健康衰老提供重要的遗传学依据。  单核苷酸多态性(SNP)被称为是第三代遗传标记,由于其在人类染色体上分布广泛、数目多且相对稳定,因此在遗传性疾病的研究方面日益受到广大研究者们的青睐。目前已有很多研究证明在日本、意大利、德国、法国和中国的人群中FOXO3的多态性和长寿密切相关,此外FOXO3在其他模式动物例如线虫、果蝇和小鼠中的同系物也曾经被学者证明会影响新陈代谢和寿命长短。因此本研究旨在探索中国海南长寿家系中SNP的分布模式,同时为了能结合基因的表达数据进一步研究SNP的作用方式,本文以样本的转录组数据为研究基础。  本课题,采集并获得中国海南长寿家系431例外周血样本的转录组数据,其中汉族群体样本310例,包括133位长寿老人、100位长寿老人的F1代和77位F1代配偶,黎族群体样本121例,包括49位长寿老人、34位长寿老人F1代和38位F1代配偶,F1代配偶与长寿老人没有血缘关系且生活在相同的环境中,在本研究中作为长寿老人的对照。在上述转录组数据基础上进行SNP检测分析,发现在长寿老人和对照里存在诸多显著差异的SNP位点(P<0.05),进一步的表达数量性状基因座(eQTL)分析表明部分SNP确实可调控某些基因的表达。结合已发表的常见的老年病的芯片表达数据,发现部分基因在长寿老人和对照、老年病患者和对照里都显著差异表达且差异表达方向相反。综上所述,本研究结果表明长寿老人确实携带一些SNP(rs13306、rs6763154、rs199991437、rs521040、rs1167206、rs11247857、rs136069、rs1126327、rs28520953、rs889916、rs1039593),它们通过调控基因的表达来抑制一些重大老年疾病的发生,这可能是长寿老人健康长寿的重要原因。
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