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为了应对水源水质的恶化以及满足日益严格的饮用水水质标准，生物活性炭(BAC)技术作为深度处理技术已经在世界各国得到广泛的应用。以往研究者对生物活性炭上生物膜的生物量和活性进行了大量研究，然而目前却缺乏对生物膜的微生物群落结构和生态功能、以及影响因素的了解。此外，随着该工艺应用于饮用水处理，出水安全性也受到重视。BAC上附着的微生物可能脱落，进入到配水管网而对使用者造成威胁。因此本论文以处理受污染湖水的水处理工艺作为研究对象，基于分子生物学技术（TRFLP、基因克隆文库、高通量测序）探讨了生物滤池中微生物群落的空间变化以及运行条件和环境因素的影响，并对生物处理的可能微生物学风险进行评估。 论文主要结果和结论如下: (1)中试规模的生物活性炭滤池内生物量、生物活性及细菌群落多样性都随着水流方向递减，滤池内部的群落结构存在较大的差异。Alphaproteobacteria、Gammaproteobacteria和Acidobacteria是滤池内的主要优势菌。此外，生物滤池内检测出了类似致病菌Novosphingobium aromaticivorans的微生物。 (2)饮用水处理工艺能显着降低水中异养细菌数量，并显著改变了水中的微生物群落结构。虽然炭滤池出水的常规生物学指标能满足国家生活饮用水标准，但基因克隆文库技术分析表明，砂滤池出水和炭滤池出水中仍然检测出多种可能的致病菌。 (3)进水中DOC和氨氮的浓度会对活性碳上生物膜的生物量、微生物多样性及群落组成结构产生很大影响。高通量测序技术是研究饮用水滤池中微生物群落结构和多样性的一个强有力的工具。