CAS-LIBB微束细胞定位辐射系统集成应用研究

来源 :中国科学院等离子体物理研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pootcat
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单粒子微束装置是一种独特的辐射生物学研究工具,它能够精确控制穿过单个细胞的粒子数量。为了实现这一水平的控制,该装置的许多部件和子系统必须被作为用户和物理硬件之间接口的软件来集中控制。中国科学院粒子束生物工程学重点实验室(CAS-LIBB)正在设计和测试这种控制软件。该软件是用微软公司的Visual Basic语言在面向对象的架构上写成的。它包括几个工具可以用来完成图像采集,图像处理,样品定位和束线控制等功能。本文介绍了CAS-LIBB单粒子微束系统的技术进展。主要内容包括:   ⑴校准图像采集系统。通过该校准工作我们可以确定束线精确位置并能计算出三个坐标系(细胞盘坐标系,显微镜坐标系和样品架坐标系)之间的转换系数。   ⑵CAS-LIBB单粒子微束的控制软件中,粒子(样品对象)计数工作应该自动完成。找出图像中感兴趣的对象的方法就是图像分割,其中心问题是选择分割阈值。为了提高系统处理细胞的通量,阈值的选择应该自动完成。有许多算法可以用来计算阈值,我们使用的是Otsu方法。因为并不是所有的图像都能被使用闽值成功分割,所以,当不能自动识别对象时,可以很方便地使用鼠标“选取”坐标的功能。   ⑶因为通常样品区域比显微镜一个视野的面积要大,因此需要采集多幅图像才能覆盖整个样品区域,这样会带来很多问题。为了解决这些问题,借助于图像拼接方法,我们设计了一种把显微镜视场拼接成一幅能够覆盖整个培养皿区域的完整图像的方案,实现了自动辐射的目的。
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