【摘 要】
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研究背景:生物活性多肽是机体内部一类重要的细胞间信号传递分子.几乎所有的生物活性多肽前体原序列的N端都存在一段信号肽序列,这段序列能帮助活性多肽分泌到细胞周质中或者
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研究背景:生物活性多肽是机体内部一类重要的细胞间信号传递分子.几乎所有的生物活性多肽前体原序列的N端都存在一段信号肽序列,这段序列能帮助活性多肽分泌到细胞周质中或者定位到细胞器中.信息技术和计算机技术在生物学中的应用导致了生物信息学的诞生,数据库技术以及Internet为海量的分子生物学数据的储存,管理,共享以及应用提供了方便.为了给生物活性多肽的实验研究提供信息支持,整合已有的生物活性多肽数据,挖掘埋藏于大量数据后面的知识,我们很有必要建立一个关于生物活性多肽的网络信息平台.研究方法:我们利用Delphi开发了一套软件工具实现了从网络上自动下载以及分选生物学数据.数据搜集以基因和蛋白质为中心,从分子生物学网络数据库中下载相关数据.以关系型数据库管理系统来储存和管理这些数据,建立了生物活性多肽数据库-BioPD.结论:BioPD是一个基于网络的关于生物活性多肽的信息平台.数据库整合了蛋白质序列及其注释信息,基因序列及其注释信息,蛋白质相互作用和多肽相关疾病的信息,并提供了尽可能完整的文献来支持以上数据.BioPD分为PROTEIN,GENE,DISEASE,LINKS,INTERACTION和REFERENCE六个部分,提供了丰富的查询和浏览功能.数据库通过Web的方式对外发布,其网址为:http://biopd.bjmu.edu.cn.另外,作为生物学数据库的一个应用,我们把BioPD作为蛋白质和基因序列信息仓库,从中提取了所有的信号肽序列,并对这些信号肽序列进行了一些统计学分析.
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