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本研究建立了一套可以一次检测两种马铃薯抗病毒分子标记的辅助育种技术体系，该体系稳定且易于操作，为加速马铃薯抗病毒品种选育提供了手段。主要结果如下：1.从9个收集到的与马铃薯抗病毒相关的分子标记中筛选出了两个分子标记RYSC3和Rxsp，分别与PVY病毒和抗PVX病毒的抗性连锁。经过验证，两标记具有稳定性好、扩增条带清晰、检测过程简便等优点，并且标记基因来源于广泛应用于育种中的四倍体安第斯亚种，具有作为分子标记辅助选择的前提条件。2.经过对22份资源材料的标记分析和抗性鉴定，筛选出了病毒抗性分离群体的杂交亲本：对PVY和PVX病毒具有抗性且含RYSC3和Rxsp标记的四倍体材料C120作为母本；对PVY和PVX病毒不具有抗性且不含RYSC3和Rxsp标记的四倍体材料Ca11作为父本。3.构建了含139个基因型的后代分离群体。分离群体PVY和PVX抗性接种鉴定、RYSC3和Rxsp标记分析结果显示：RYSC3和Rxsp标记分别与PVY和PVX病毒抗性紧密连锁，可用于复合PCR体系的建立。4.在国内率先建立了能同时检测RYSC3和Rxsp标记的多重PCR体系，经F1代分离群体验证，结果稳定可靠。该复合PCR体系快速、准确且成本较低，可以应用于种质资源的抗病毒分子标记筛选和抗病毒育种中分子标记辅助选择。5.利用RYSC3和Rxsp标记对190份国内主要育成品种进行了分析。筛选出30份品种可用于抗病毒育种，占总品种数量的15.8%，可以作为抗病毒育种的亲本。其中，22份品种具有RYSC3标记，占总品种数量的11.6%；15份品种具有Rxsp标记，占总品种数量的7.9%。在含有这两种标记的品种中，40%以上为新型栽培种和来源于国际马铃薯中心的资源育成的品种，50%以上为2001年之后审定的品种。6.利用RYSC3和Rxsp标记对699份国外引进育种资源进行了分析。筛选出296份材料可用于抗病毒育种，占总材料数量的42.4%，可以作为抗病毒育种的亲本。其中，202份材料具有RYSC3标记，占总材料数量的28.9%；157份材料具有Rxsp标记，占总材料数量的22.5%；国际马铃薯中心(CIP)引进的资源材料含RYSC3和Rxsp标记比例最高，分别为36.8%和39.9%。该结果表明，从CIP引进的资源含有优良抗病毒基因的比例较大，加速应用CIP资源材料有助于我国马铃薯抗病毒品种选育。