【摘 要】
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目的:为了明确核酸脉冲场凝胶电泳(PFGE)与多位点串联重复序列(MLVA)对肠出血性大肠杆菌的分型效果,本研究对日本2005年分离自多个县域的散发和爆发病例的100株EHECO157:H7菌
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目的:为了明确核酸脉冲场凝胶电泳(PFGE)与多位点串联重复序列(MLVA)对肠出血性大肠杆菌的分型效果,本研究对日本2005年分离自多个县域的散发和爆发病例的100株EHECO157:H7菌株进行了PFGE与MLVA的分子流行病学分析。为EHEC的传染来源的追踪提供更为有分辨力的分子分型方法,同时为第二代Pulsenet的原则构建提供参考。
方法:本实验采用PCR方法对这100株菌株进行了stx1与stx2的鉴定。采用PFGE对这100株菌株进行了Xba I、Bln I或Spe I的限制性酶切,然后通过Hyytia-Trees发表的引物位点及PCR反应体系,对具有不可区分PFGE模式的EHEC O157:H7菌株的MLVA的区分能力进行评价。
结果:所有的菌株都含有stx1,65株菌含有stx2。 xba I酶切后,将100株菌分成了7个明确的型别,分别为52、112、a230、a27、a491、413与a264。通过应用MLVA系统,我们发现在PFGE分析中属于同一群落的3个群落的菌株(a230、a491与a264)也具有一致的MLVA型别,而另外4种群落的菌株(52,112,a27与413)则被进一步区分为不同的EHEC O157:H7群落。具有不可区分PFGE模式和MLVA型别的3个群落的菌株均自分布在多个县相距几个月发生的散发病例分离得到。
结论:对本次研究中分析的100株菌株而言,MLVA显示出比PFGE更高的区分能力,在疫情爆发时,更适合对菌株的传染来源进行分子流行病学的追踪。
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