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本论文对南充炼油厂石化废水处理系统中投加的高效芳烃降解菌株Rhodococcus ruber Em1数量变化进行了定量跟踪检测，并分析了该菌株在废水处理过程中发挥的重要作用。
根据Rhodococcus ruber Em1菌株的16S rRNA基因序列，设计特异性引物，运用竞争性定量PCR(Quantitative Competitive-Polymerase Chain Reaction)技术，对南充炼油厂石化废水处理系统进行近半年不定期的活性污泥样品采集，对污泥样品中Rhodococcus ruber—Em1菌株定量测定，同时结合系统的运行处理效果，分析菌株在废水处理中的变化趋势和功能。结果表明，基于Em1菌株16S rRNA基因序列所设计的引物具菌种水平的特异性，对PCR产物克隆测序表明所扩增的产物中62.22％为Em1菌株16S rRNA基因片段。QC-PCR检测表明活性污泥样品中Em1菌株数量范围为3.4×105～4.3×108 CFU·g-1，表明所投加的高效降解Em1菌株可以在处理系统中长期稳定存在并占优势；相关性分析表明菌株Em1的数量与COD去除量之间的相关性系数(R2)高达0.89，说明Em1菌量与废水系统的处理效果具有明显的正相关性。
以上结果说明，投加的Em1菌株在高浓度多环芳烃等污染物存在的条件和复杂菌群环境中，仍能长期稳定地存活并繁殖，且占居优势菌群的地位；同时表明Eml菌株在该废水处理系统中发挥重要的作用。证明了该高效菌株具有较强的环境适应能力和较好的工业应用前，促进了石油芳烃高效降解菌株从实验室对降解途径和分子机理的研究到实地污染处理的工程应用。