急性髓系白血病化疗相关的甲基化修饰的研究

来源 :宁波大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hesehuzi
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目的:本次研究是通过荟萃分析、甲基化特异性 PCR(MSP)以及焦磷酸测序对宁波地区汉族人群进行候选基因甲基化的检测,探讨这些基因甲基化的改变与急性髓系白血病(AML)化疗的相关性。  方法:运用Review manager5.2软件对 CDKN2A,GLIPR1,CDKN2B,SHP1,ID4等基因的甲基化与白血病相关性以及 CDKN2A,CDKN2B,ID4基因的甲基化与 AML的相关性进行荟萃分析。采用甲基化特异性 PCR(MSP)检测候选基因 CDKN2A,SLC19A3,DLEC1及 MGMT,APC2,CYP1B1分别在15例及30例年龄、性别、临床指标都相近的AML患者化疗前后的甲基化变化。此外运用焦磷酸测序对 AML患者的NDRG4基因的CpG岛进行 DNA甲基化检测并分析NDRG4基因与 AML患者化疗的相关性。  结果:(1)荟萃分析:CDKN2A能增加253%的白血病患病风险(p=0.006,OR=3.53,95%CI=1.43-8.73),GLIPR1能增加496%的白血病患病风险(p=0.0002,OR=5.96,95%CI=2.29-15.46)。CDKN2B能增加867%的白血病患病风险(p=0.001,OR=9.67,95% CI=2.48-37.75)。SHP1基因的高甲基化与白血病风险增加相关(p<0.00001,OR=29.27,95%CI=6.80-125.99)。DAPK1的高甲基化与白血病的风险增加相关(p<0.0001,OR=28.85,95%CI=5.54-150.14)。S O C S1基因的DNA甲基化是白血病的保护因子。此外,CDKN1C以及RARA的甲基化与白血病之间并未发现明显的关联。  (2)荟萃分析:CDKN2A的高甲基化与 AML的风险增加相关(p=0.01,OR=8.63,95% CI=1.52-48.91)。CDKN2B基因的甲基化与AML风险增加相关(p=0.03,OR=31.92,95% CI=1.37-742.18)。ID4的高甲基化与 AML的风险增加相关(p<0.00001,OR=87.52,95%CI=16.05-477.38)。  (3)病例研究:APC2与 SLC19A3基因的甲基化在 AML化疗前后均未发生改变可能与 AML化疗不相关。AML患者化疗后 CDKN2A基因通常伴随甲基化的升高,MGMT基因更易发生甲基化的降低,CYP1B1基因更易表现出甲基化的升高。化疗后CDKN2A基因及 DLEC1基因甲基化状态的改变可能分别仅在男性和女性中发生,可能具有性别差异性。DLEC1基因的高甲基化可能导致较差的预后。MGMT启动子区男性的患者较女性患者更易发生化疗诱导的甲基化的改变。AML患者化疗后通常伴随MGMT基因甲基化的降低,并且 M4亚型(3/6)较其他亚型(M1,1/3;M2,0/8;M3,3/7;M5,0/3;M6,1/3)的患者对化疗更加敏感更易导致甲基化发生改变。与年龄>60岁的患者(16.7%,1/6)相比化疗诱导的MGMT基因甲基化改变更常发生在年龄≤60岁的患者中(29.2%,7/24)。CYP1B1基因甲基化的变化更易出现在大于60岁的患者中(33.3%,2/6),CYP1B1基因中,相较于其他亚型的患者(M1:33.3%;M2:12.5%;M4:16.7%;M5:0%;M6:0%) M3亚型的患者更易发生甲基化水平的改变(57.1%)。  (4)病例研究:化疗后AML患者中M2亚型患者相比其他亚型的患者NDRG4甲基化降低更加显著(化疗前:9.91±6.00%;化疗后:5.26±2.81%,p=0.038),NDRG4甲基化改变与AML患者年龄显著正相关,特别是M2亚型的患者(r=0.761,p=0.047)。
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