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随着国家财政体制改革和公共财政体系的建立和完善，国家逐渐退出了竞争性、盈利性投资领域，政府投资重点转向了公共工程项目。特别是近些年来国家财力的迅速增长，国家公共开支的大幅增加，经济资源与需求的矛盾日益尖锐，人们对提高经营部门支出的效益和明确支出经济责任的要求越来越高。不庸讳言，政府的公共工程投资项目在有效推动经济增长的同时，也暴露了一些不容忽视的问题，投资绩效不理想，损失、浪费不同程度地存在，经济犯罪问题时有发生。面对这种情况，传统的审计着眼于真实、合法，仅仅停留于“对不对”已不能满足社会的需求，以“好不好”为目标的绩效审计逐渐开展起来。审计署早在《2003年至2007年审计工作发展规划》中提出“积极开展绩效审计，促进提高财政资金的管理水平和使用效益”，要求审计机关不仅要对项目建设资金使用中的不合法，不合规行为进行审计，而且要对资金使用的效益、效率、效果进行审计，把绩效审计作为当前审计工作的一项重要任务来抓，争取到2007年，投入效益审计力量占整个审计力量50％以上。
绩效审计就是对被审计项目的经济性、效率性、效果性进行评价，绩效审计一方面加重了政府审计部门的责任，另一方也把政府审计推向了更加广阔的领域，能否不失时机地深化绩效审计，已成为衡量一个国家审计是否具有活力的标志之一。由于在我国的开展时间不长，现实效果还很不理想，目前正处于探索阶段。
本论文就政府公共工程投资绩效审计研究遵循以下基本思路：首先介绍该课题研究的现实意义和国内外绩效审计发展现状。其次，阐述了政府公共工程和绩效审计的定义，分析了政府公共工程绩效审计产生和发展的理论基础。第三，详细阐述了M市政府公共工程涉农投资绩效审计现状，并就有关问题进行分析。第四，着重阐述了完善M市政府公共工程投资绩效审计的对策，分别从法律、政策、技术层面，尤其是建立合适的评价体系等方面提出自己的思考。