【摘 要】
：
随着时代的发展,癌症已成为威胁人类生命的主要原因,仅2016年,就有890万人死于癌症。治疗癌症的药物却明显不足,并且大多数的治疗过程会产生抗药性,这使得药物开发极为重要。然而传统的药物开发时间漫长、投资巨大、风险极高,药物重定位作为新药研发的替代方法可以有效降低开发风险、缩短药物研发时间、节省研发成本。目前基于转录组的药物重定位方法只考虑了差异表达显著的基因,而忽略了与疾病联系密切的致病基因。因
论文部分内容阅读
随着时代的发展,癌症已成为威胁人类生命的主要原因,仅2016年,就有890万人死于癌症。治疗癌症的药物却明显不足,并且大多数的治疗过程会产生抗药性,这使得药物开发极为重要。然而传统的药物开发时间漫长、投资巨大、风险极高,药物重定位作为新药研发的替代方法可以有效降低开发风险、缩短药物研发时间、节省研发成本。目前基于转录组的药物重定位方法只考虑了差异表达显著的基因,而忽略了与疾病联系密切的致病基因。因此,本文提出了基于差异表达基因和致病基因的药物预测方法。在基于差异表达基因和致病基因的药物预测方法中,充分考虑了致病基因对于疾病的重要性。该方法首先对疾病下差异表达显著的基因和致病基因按照差异值升序排序,顶部为下调基因,底部为上调基因。然后将下调的致病基因加入到最顶部,上调的致病基因加入到最底部,构成疾病的查询基因集合。接着基于Kolmogorov-Smirnov统计方法计算药物与疾病的关联分数并使用比较毒性数据库计算预测结果的准确度。最后,通过与不考虑致病基因的连接图方法进行准确度对比发现本文提出的方法准确度更高。此外,文章对更感兴趣的乳腺癌疾病预测的前30种药物进行了文献验证和KEGG路径验证。基于对以上结果的分析提出假设:高差异表达的基因可能是噪声,其对预测结果有反向作用,即降低预测的准确性。因此提出筛选算法对疾病的差异表达基因进行筛选,得到疾病的最优差异基因集合。首先利用乳腺癌数据进行实验,得到乳腺癌最优差异基因集合,然后利用乳腺癌最优差异基因集合对应的差异表达阈值对其他十六种疾病进行实验,结果发现其中有十种疾病存在噪声。因此,利用这十组疾病数据建立了预测疾病基因集合阈值的模型,并通过六种癌症数据对模型进行了验证,发现预测的前十种药物的准确度至少提高10%,其中疾病肉瘤的准确度提高了30%。此外,为验证模型对于非癌症数据的适用性,使用了两种非癌症数据进行验证,发现模型对于非癌症数据的准确度也有10%的提高。本文通过研究发现,在考虑与疾病关系密切的致病基因的情况下,可以使结果的准确度提高。此外,基于差异表达基因和致病基因的方法对于有致病基因的疾病数据而言简单快捷且准确。对于没有致病基因的疾病数据使用构建的模型来预测出基因集合的表达阈值,得到疾病的最优差异基因集合也可得到准确度较高的预测结果。
其他文献
对河流、水库、湖泊等流域的水位监测是预防洪涝灾害和干旱发生的一个关键环节。随着视频监控技术和网络信息化技术的发展,利用视频监控系统监测水位日益普及。水利部门通常在河流域设置水位监测点,安装水尺和摄像头,利用视频监控人工观测获取水位信息。该方式任务繁重且难以做到实时性,因此,研究基于视频图像的实时、自动、准确的水位监测方法和技术具有紧迫性。本文设计了一个基于Faster R-CNN与Grab Cut
本报告的原文来自作者在翻译公司实习期间的一个项目。原文是关于电气化快速列车建设,属于商务型文本。作者主要负责该项目中的第四卷承包商选择部分的翻译。为了适应新时代便捷、高效的要求,各国必须继续对自身的交通轨道系统进行更新换代,该项目便是在这一大背景下应运而生。甲方需要通过各方面来考察参与竞争的承包商是否符合要求,承包商也需要将甲方所提出的要求作为参与竞争的参考。因此,第四卷的翻译对于合作双方来说都尤
溴氰菊酯(DLT)是一种拟除虫菊酯类低毒性农药,遍及农业和家庭害虫防治领域。DLT有拟雌激素活性,是一种环境内分泌干扰物,长期低剂量暴露会产生生殖毒性。卵巢作为雌性哺乳动物主要的生殖和内分泌器官,其主要功能是分泌甾体激素和排卵,这些过程受到卵泡发育的密切调控。研究报道DLT对昆虫卵巢有毒性作用,但还没有关于DLT影响哺乳动物卵巢功能的相关报道,因此本研究探讨了 DLT对大鼠卵巢内卵泡发育和甾体激素
目的:本研究通过横断面调查了解延边地区ICU护士导管相关血流感染的知信行现状,比较ICU护士导管相关血流感染知信行水平在一般人口学特征上的差异;分析ICU护士导管相关血流感染知识、态度与行为三者之间的相关关系;探讨影响ICU护士导管相关血流感染行为的主要因素;研究ICU护士对导管相关血流感染知识的知晓情况及接受培训情况,为导管相关血流感染的防护教育与培训提供参考依据。方法:本研究采用刘晓颖编制的《
作为21世纪诗歌样态的重要组成部分,“打工诗歌”自开始出现就吸引了众多诗人与评论家的眼球,它不仅真实的展现了打工者的人生轨迹,更记录了变革时代的群体心理与民族记忆,因此在当代诗歌史中具有其独特的意义和价值。本论文正是将其作为一种宏观的诗歌现象,而非微观的文本层面进行考察,从“打工诗歌”的肇始,它的现实主义精神向度,它所折射的诗坛生态,以及它的退潮和出路这四部分入手,对其做了较完整系统的论述。论文第
川乌为毛茛科植物乌头(Aconitum carmichaelii Debx)的干燥母根,是传统的药用植物,药用的历史悠久并且药用价值高。但是,不同来源或不同产地的川乌药材质量差异较大,不同厂家或不同炮制方法制成的制川乌其质量更是不可控,导致临床用药的疗效出现差异,因此,建立统一的川乌和制川乌的质量标准及等级划分标准,保障川乌的质量稳定性,提高临床疗效是中药创新发展必须要解决的问题。本文以川乌及其饮
文化自信是一个国家或民族生存和发展的立身之本,它是国家和民族不断发展的源源不断的精神动力。大学生是推动文化传承与发展的重要力量,只有他们树立起坚定的文化自信才能促进文化的传承和创新,才能推进建设社会主义现代化强国和中华民族伟大复兴的进程。随着互联网技术的升级、传统媒体与新媒体逐渐走向融合,融媒体由此诞生。它实现了多个媒体平台的整合,拓宽了大学生获取文化知识和信息的渠道,极大的强化了信息传播的效果,
层状结构的NaMnO_2正极材料具有理论容量高、成本低、污染小等优点,但材料自身由于Jahn-Teller效应导致结构坍塌造成循环稳定性差等问题,阻碍了材料的发展及应用。针对正极材料NaMnO_2存在的缺点,本文探索了相同价态的阳离子,不同价态的阳离子、阴离子掺杂以及阴阳离子协同掺杂的方法对材料的改性研究。采用高温固相法合成材料NaMnO_2,探究不同煅烧条件和不同负极对材料NaMnO_2电化学性
如今,视频已经成为人们生活中不可或缺的部分,短视频、直播和视频会议等不断丰富着人们的日常生活。为了能够提升视频传输质量,根本途径是提高视频的压缩效率,减少视频传输的数据量。以获得超出已有视频编码标准的压缩能力并对各种新兴视频具有高度的通用性为目标,下一代国际视频编码标准,多功能视频编码(Versatile Video Coding,VVC),正在制定之中,预计2020年发布。当前阶段,VVC虽然获
当今国际形势纷繁复杂,大国关系瞬息万变,我国的外交工作面临许多新问题、新挑战。值此之际,在十九次全国人民代表大会上,习近平总书记提出的中国特色大国外交,赢得了世界的广泛关注。近年来,随着中国的综合国力迅猛发展,中国在世界舞台上越来越活跃,在这个过程中难免会有一些势力会对中国的发展感到困惑,难免会遭遇到一些阻力。因此我们需要向世界传达“中国声音”,讲好“中国故事”,赢得更多的理解。由于中国特色外交凝