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本研究分别以秦川牛、鲁西牛、西门塔尔牛和安格斯牛4个品种牛的514份血样和西门塔尔牛的组织样为材料,分别提取基因组DNA和RNA。运用生物信息学方法和同源序列克隆技术结合电子PCR (ePCR)、反转录PCR (RT-PCR)和限制性片段长度多态性PCR (PCR-RFLP),对牛的视黄素受体γ(RXRG)基因的cDNA序列和基因组DNA序列进行了克隆、鉴定与序列分析。运用测序和PCR-RFLP结合的方法对视黄素受体γ(RXRG)基因和生肌决定因子1 (MyoD1)基因的部分基因组DNA片段进行了单核苷酸多态检测,运用一般线性模型研究了MyoD1基因与上述6个品种牛部分生长与肉质性状的相关性,运用Logistic概率型非线性回归分析和卡方独立性检验研究了RXRG基因与上述6个品种牛双胎性状的相关性,得到了如下结果:(1)利用RT-PCR技术,对牛RXRG基因进行克隆,将得到的片段重组到PMD19-T载体进行序列测定。获得了一个长为1811 bp的cDNA片断。通过氨基酸序列分析发现,牛RXRG基因的该片段由10个外显子组成,编码463个氨基酸。与其他动物同源性比较表明,该基因与人、猪、猕猴、小鼠、大鼠在氨基酸序列上分别有89.5%、93.4%、87.2%、83.9%、85.2%的同源性。获得了牛RXRG基因的cDNA序列。组织表达谱分析表明,牛RXRG基因在肌肉中高度表达,在其他组织中不表达。(2)运用测序法寻找牛RXRG基因SNPs,筛查到一个新的多态位点A1941G,该位点位于3′非编码区。运用PCR-RFLP法验证并分析该位点在鲁西牛双胎群体和单胎群体及西门塔尔牛、安格斯牛和西蒙杂交牛单胎群体间的多态性,结果表明,在鲁西牛双胎和单胎群体中分布A、B两个等位基因,处于中度多态。经卡方适合性检验,鲁西双胎牛群体在该位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。将鲁西牛群体的A1941G位点的基因型效应与双胎性状进行关联分析,卡方独立性检测结果显示,基因型分布在鲁西单、双胎牛群体上差异达到极显著水平(P<0.01)。(3)运用测序法寻找牛MyoD1基因SNPs,筛查到一个新的多态位点C1867T,该位点C-T突变引起甘氨酸/丝氨酸的转变。运用PCR-RFLP法验证并分析该位点在不同群体间的多态性,并与相应牛群体的胴体性状进行关联分析。结果显示,西门塔尔牛、鲁西牛群体的C1867T位点的突变达到了Hardy-Weinberg平衡状态,而秦川牛未达到平衡状态。不同基因型对肉牛的背膘厚影响差异极显著(P<0.01),对大腿肉厚的影响显著(P<0.05),对日增重、屠宰率、肌间脂肪、大理石花纹、嫩度的影响差异不显著。