【摘 要】
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水稻黄矮病毒是一种含单链、负极性RNA基因组的植物弹状病毒.该研究利用基因3和基因6末端片段为探针,通过朝未知基因方向步进的方法,从RYSV基因组RNA的cDNA文库中筛选得到了
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水稻黄矮病毒是一种含单链、负极性RNA基因组的植物弹状病毒.该研究利用基因3和基因6末端片段为探针,通过朝未知基因方向步进的方法,从RYSV基因组RNA的cDNA文库中筛选得到了覆盖RYSV M基因和G基因序列的克隆,并测定了它们的核苷酸序列.M和G基因序列的测定促成了RYSV基因组的全序列分析:RYSV基因组全长14042个核苷酸,共含有七个基因,其中基因6是植物弹状病毒中发现的一个新基因.M基因共含913个核苷酸(nt),包括17nt的5′非编码区、789nt的编码区和107nt的3′非编码区.M基因编码的蛋白质含262个氨基酸,计算分子量29,125Da.血清学实验证明M基因编码RYSV的M蛋白.RYSV的M蛋白与其它弹状病毒M蛋白无明显的序列同源性,但它们的氨基酸组成及结构特点却很相似,如含有较多的碱性氨基酸、酸性氨基酸区与碱性氨基酸区相间排列等.G基因全长2158nt,包括45nt的5′非编码区、2010nt的编码区及103nt的3′非编码区.G基因编码的蛋白质分子量75,358Da,含669个氨基酸,具有典型的弹状病毒糖蛋白的结构特点,N端有一个由32个氨基酸组成的信号肽,C端含有一疏水性氨基酸组成的跨膜区,另外还存在10个糖基化位点和一些可能的磷脂结合域.用3′RACE和5′RACE的方法确定了RYSV所有基因的转录终止位点及部分基因的转录起始位点,证明RYSV各基因间存在保守的基因间隔序列并发现了基因转录物的新的结构特征:1)M、G、L基因和基因6的转录物的5′端存在非病毒来源的核苷酸序列;2)正链leader RNA 3′末端带有poly(A)尾.
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