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随着地球上化石能源(石油、煤炭、天燃气等)的日趋枯竭和全球环境保护意识的不断加强,用生物乙醇(也称燃料乙醇)取代部分汽油已经成为一项重要的可再生能源战略。由于技术上的原因,目前燃料乙醇的生产主要是通过酿酒酵母对淀粉质或糖质原料的发酵来实现。以淀粉质或糖质原料为碳源进行乙醇发酵,原料成本在生产总成本中占很大比例,这在一定程度上限制了燃料乙醇工业的发展。因此,提高酿酒酵母乙醇发酵过程中的原料利用率(糖-醇转化率)以及降低生产过程中的能耗(如:缩短发酵周期、采用浓醪发酵等)是关系到淀粉质及糖质原料乙醇发酵行业发展的重要课题。然而,酿酒酵母乙醇发酵的糖-醇转化率、发酵速率以及对乙醇的耐受力是受多基因调控的复杂遗传性状,很难通过传统的诱变育种、代谢工程以及针对特定基因或代谢途径的其它遗传操作方法进行改善。因此,采用全基因组系统工程的方法对酿酒酵母进行遗传改造无疑是解决上述问题的有效途径。本研究以YCplac33为载体,构建带有受半乳糖诱导启动子调控的HO基因的质粒YCplac33-GHK。将该质粒转入酿酒酵母菌株W303,通过半乳糖诱导HO基因转录来实现转化菌株交配型的转换。通过菌落PCR分析菌株的交配型,选择适当交配型的酵母菌株进行有性接合,获得多倍体菌株HLH33和HLH34。实验结果表明:在浓醪发酵中,菌株HLH33和HLH34分别比对照菌株W303的乙醇产量提高了1.29%和3.57%;酵母菌株的乙醇产量和对乙醇及高渗透压的抗性随染色体倍数的增加而提高和增强。用芬苯达唑(methyl benzimidazole-2-yl-carba-mate,MBC)处理多倍体菌株HLH34使之发生染色体缺失,得到一株乙醇发酵特性显著改善的非整倍体酵母菌株HLH34-M。实验结果表明:在浓醪发酵中,菌株HLH34-M与对照菌株W303相比,发酵终点残糖降低了58.70%,乙醇产量提高了5.33%。同时,菌株HLH34-M对乙醇及高渗透压的抗性明显增强。研究结果证明,非整倍体菌株可以显著地改善酿酒酵母的乙醇发酵生产特性。用常规重组DNA技术将编码全局转录因子的基因SPT15和SPT3分别克隆到载体YEplac195上,得到质粒YEplac195-SPT15和YEplac195-SPT3;采用PCR介导的定点诱变技术,获得SPT15的等位基因spt15( Phe177Ser、Tyr195His、Lys218Arg),并将其克隆到YEplac195载体上,得到质粒YEplac195-spt15;此外,分别将SPT15和SPT3以及spt15和SPT3共同克隆到YEplac195上,构建出质粒YEplac195-SPT15-SPT3和YEplac195-spt15-SPT3。上述所有质粒上的SPT15和spt15均由TEF1强启动子调控,而SPT3则由PGK1强启动子调控。将所构建的质粒分别转入菌株W303,并对转化子的乙醇发酵能力和乙醇及高渗透压的抗性进行考察。实验结果表明:与对照菌株W303相比,过量表达转录因子SPT15和spt15的菌株乙醇产量分别提高了1.14%和0.23%;共同过量表达SPT15和SPT3及共同过量表达spt15和SPT3的菌株乙醇产量分别提高了2.05%和1.70%;过量表达转录因子SPT3的菌株乙醇产量提高了1.25%,而且该菌株具有较强的乙醇及高渗透压的抗性。研究结果说明:在本研究实验条件下,对于SPT15和SPT3的遗传操作可在一定程度上提高酵母的乙醇发酵能力。在确定甲基磺酸乙酯(Ethyl methane sulphonate, EMS)最佳诱变剂量的基础上,对双倍体酵母菌株W303进行诱变,获得具有充分遗传多样性的菌株群;通过三轮有性重组进行基因组重排,构建出具有优良特性的酿酒酵母乙醇发酵菌株HLHS3-7。实验结果表明:在浓醪发酵中,菌株HLHS3-7比对照菌株W303的乙醇产量提高了8.88%,残糖降低了64.37%,发酵周期缩短了10小时,而且对乙醇及高渗透压的抗性显著增强。研究结果证明:本研究采用的策略是一种有效的酿酒酵母乙醇发酵菌株改造方法。