霍乱弧菌和炭疽芽孢菌基因快速检测体系的建立

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背景:霍乱是由霍乱弧菌引起的一种烈性肠道传染病。通过污染的水和食物传播,自1817年至今霍乱已发生7次全球性大流行,据世界卫生组织(WHO)报告,霍乱每年发生病例10万例,给人们生命健康及社会经济发展带来极大威胁。采用以分离培养为基础的传统检测方法工作量大,耗时长,对于一些含菌量低的标本,或处于VBNC状态的霍乱弧菌检出率低甚至不能检出。以核酸检测为基础的基因诊断方法,因为其对标本要求低,灵敏快速,正成为霍乱诊断研究领域的研究重点。方法:以霍乱弧菌毒素编码基因ctx和O抗原编码基因rfb作为靶基因,将ctx基因序列、O1群霍乱弧菌rfb基因簇序列和O139群霍乱弧菌rfb基因簇序列用blast工具在GeneBank中比对,寻找出特异保守的1rfb序列、9rfb序列、ctx序列,作为检测的标志序列。针对检测标志序列设计引物和探针,并构建1rfb、9rfb和ctx的克隆。对提取的质粒进行紫外定量,再倍比稀释,制成标准品。用标准品优化反应条件,建立三重taqman实时PCR检测体系。将霍乱疫苗定量倍比稀释后,接种至健康人的大便标本中,制成模拟的霍乱患者临床标本。以23种肠道菌作为阴性对照菌,以质粒标准品和模拟标本作为阳性样品,用以评价所建检测体系的灵敏度。结果:以质粒为检测对象,检测体系灵敏度可达10拷贝/反应体系。采用大便作为检测标本,检测体系灵敏度可达10CFU/g。对23种肠道菌进行多次重复试验,均没有扩增曲线出现,说明检测体系具有较好的特异性和敏感性,且整个反应可在3小时内全部完成。结论:本研究采用taqman探针技术建立霍乱弧菌三重实时PCR检测体系,检测灵敏度高,特异性好,速度快,一次反应可实现对霍乱弧菌定性、定量、分型以及毒性检测的目的,有望在临床检验、食品卫生、疾病控制和出入境检验等领域发挥重要的作用目的:以炭疽芽孢杆菌的主基因和致病毒素基因pagA特异性序列为检测标志,建立高敏感高特异的荧光双重实时TaqMan聚合酶链反应快速检测体系。方法:根据炭疽杆菌主基因组特异性序列(GS)和特异的毒力岛pagA基因序列(Pag)设计引物及探针,通过构建目的质粒获得标准模板,利用TaqMan标记探针和便携式Smancycle实时聚合酶链反应检测平台探讨该检测体系的检测敏感性和特异性。结果:该体系炭疽芽孢杆菌的检测敏感度为10~2拷贝每反应体系,检测其他蜡样杆菌群细菌未出现非特异性扩增,具有较高的特异性。整个反应在1h内完成,适合于实验室或野外环境下炭疽芽孢杆菌的快速检测。结论本研究建立的双重TaqMan实时聚合酶链反应检测体系可作为炭疽芽孢杆菌快速、准确、特异、敏感的检测手段。
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