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猪流感(Swine influenza，SI)是由流感病毒引起的猪的一种急性、高度接触传染性呼吸道疾病。其特征为发病突然，高热，精神沉郁，食欲废绝，呼吸困难，阵发性咳嗽。SIV单独感染死亡率很低，但常常与其他呼吸道疾病继发或混合感染，使病情加重，死亡率增高，由此引起巨大的经济损失。此外，猪是禽流感病毒“禽-猪-人”传播链中重要的中间宿主，因此监测猪流感的流行规律将为人类流感的防控提供重要依据，具有重大的公共卫生学意义。 目前，随着猪流感感染人事件的不断发生，世界范围内猪流感的研究，已成为研究的热点。但是中国对猪流感的研究报道较少，本研究于2010年7月～2011年7月对对广东地区7个市区的规模化养猪场进行血清学调查，采集各种年龄阶段猪(种猪、保育猪、育肥猪)血清样品653份，用血凝抑制(HI)试验对血清进行检测，发现血清中存在H1、H3和H9亚型猪流感病毒抗体。HI试验检测H1亚型猪流感病毒抗体的阳性率最高为34.6％，H3亚型猪流感病毒抗体的阳性率为16.4％，H9亚型猪流感病毒抗体的阳性率为1.4％，种猪血清抗体的阳性率明显高于保育猪和育肥猪，SI具备在冬春季节多发的特点，在广东地区的猪群中未监测到H5亚型流感抗体的存在。 将广东地区7个市区猪场的280份样品(鼻棉拭子和病死猪肺脏)，通过SPF鸡胚接种分离到5株猪流感病毒。通过血凝抑制(HI)试验及序列测定分析对这5株猪流感病毒进行了HA和NA亚型的鉴定，其中H1N1亚型猪流感病毒2株，H3N2亚型流感病毒3株。本论文对其中的3株H3N2亚型猪流感病毒进行了全基因测序和遗传演化分析，经过序列分析及进化树分析发现：A/swine/Guangdong/L1/11(H3N2)毒株的8个基因片段全部处于禽源流感病毒谱系内部，该病毒属于禽源猪流感病毒。A/swine/Guangdong/L2/10(H3N2)毒株的8个基因片段全部处于近代人源流感病毒谱系内部，与近代流行的人流感病毒的亲缘关系密切，该病毒属于典型的人源猪流感病毒。A/swine/Guangdong/L3/10(H3N2)毒株的HA，NA，NS，PA基因片段处于早期人流感病毒谱系内部；NP，PB1基因处于近代人流感病毒谱系内部；M，PB2基因处于猪流感病毒谱系内部，与禽源猪流感谱系亲缘关系较远，该病毒为“人-猪”二源基因重组猪流感病毒。这3株流感病毒除HA基因外，其它所有的基因均发生了不同程度的基因重组，各基因片段与不同亚型、不同地区、不同宿主分离的不同毒株之间发生了基因重排，充分证明猪具有流感病毒“混合器”的作用。