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阴道毛滴虫(Trichomonasvaginalis)是一种寄生于人体阴道及泌尿道的鞭毛虫，该虫引起的疾病统称为阴道毛滴虫病，是最普遍的非病毒性性传播疾病之一。阴道毛滴虫除引起滴虫性阴道炎外，还会增加感染如艾滋病和乙型肝炎等其他性传播疾病的机会。该虫对人体危害较大，而且流行广泛，每年全球有超过1.7亿人感染阴道毛滴虫，虽然有关阴道毛滴虫的分子流行病学国外已有报道，但有关中国阴道毛滴虫虫株的分子流行病学研究至今未见相关的文献记载。本论文利用随机扩增多态性DNA(RAPD)等研究手段，率先对从中国分离到的阴道毛滴虫虫株进行基因多态性分析，明确它们之间的亲缘关系，为日后在我国开展毛滴虫分子流行病学研究提供有价值的分子数据。本研究通过对28株阴道毛滴虫虫株进行RAPD分析，得出其平均相似系数为74.9％。根据邻位相连法(Neighbour-Joining)，借助MEGA3.0分析软件构建系谱树状聚类图，显示出虫株间的基因差异。这些差异可能与多种因素有关，例如阴道毛滴虫对甲硝唑的抗药性、虫株的毒力及临床症状、阴道毛滴虫病毒(T.vaginalisvirus，TVV)的存在、地区差异、以及人型支原体共生等等。尤其值得注意的是，人型支原体与毛滴虫共生对RAPD结果的影响相当明显，同时也是比较容易忽视的问题之一。