长链非编码RNA-HOTIRM1、TP53TG1在人神经胶质瘤中的表达分析以及与糖代谢关系的初探

来源 :北京协和医学院中国医学科学院 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:vl244
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长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一种内源性、长度超过200个核苷酸、不编码蛋白的转录物。随着转录组测序的进步,越来越多的证据表明长非编码RNA在细胞生物学中参与多重层次的调控功能,包括在表观遗传水平,转录水平,以及转录后水平调控基因的表达。具体作用方式包括:参与组蛋白修饰复合物的组装过程,促进激素信号传导通路的激活,参与mRNA的转录后加工过程如剪接,通过同源区域与mRNA产生直接相互作用而介导mRNA的降解,与miRNA竞争性结合靶mRNA而阻碍miRNA行使功能等。   lncRNA可以影响肿瘤中的抑癌信号通路。如HOX transcript antisense RNA(HOTAIR)在乳腺癌、肝癌和结肠癌中表达异常,通过将Polycomb抑制复合物2(Polycomb Repressive Complex2,PRC2)招募到抑癌基因座位上,抑制抑癌基因的表达,从而促进肿瘤增殖并抑制凋亡。另外,在DNA损伤等应激状态下,P53可以直接诱导taurine upregulated1(TUG1)等lncRNA的表达,这些lncRNA通过与蛋白相互作用,调控与细胞周期相关基因的表达。   肿瘤具有独特的能量代谢特征。肿瘤细胞的生长增殖需要充足的物质和能量来维持,通过以下途径实现:1)增加对糖、谷氨酰胺的摄取;2)依赖糖酵解供能,而不是氧化磷酸化,即具有瓦伯格(Warburg)效应;3)合成更多的ATP、脂类、氨基酸和核酸;4)改变糖代谢过程中关键酶的活性等。   2012年,香港大学的研究人员利用lncRNA芯片,在两组人神经胶质瘤临床样本(一组268例,另一组独立样本157例作为验证)中筛选差异表达的lncRNA。对比正常脑组织,研究人员发现129条lncRNA在胶质瘤组织中表达差异高于2倍。我们希望从中寻找对胶质瘤细胞糖代谢起重要作用的lncRNA,选取HOXA反义转录物髓系异构体1(HOXA transcript antisense RNA,myeloid-specific1,HOTAIRM1)和TP53靶基因1(TP53 target1,TP53TG1)作为研究对象。   首先,我们利用Real time PCR分析HOTAIRM1和TP53TG1在人正常神经胶质细胞以及胶质瘤细胞中的表达情况。结果表明:HOTAIRM1在人神经胶质瘤细胞系中表达水平较高,TP53TG1在人正常胶质细胞中表达水平较高。   然后,我们构建了HOTAIRM1和TP53TG1的全长表达克隆及真核表达载体。并进一步探究了过表达HOTAIRM1和TP53TG1对细胞存活的影响。同时,利用Real time PCR检测HOTAIRM1和TP53TG1对神经胶质瘤细胞中一系列参与调控肿瘤糖代谢的关键基因mRNA水平的影响。MTT结果显示:HOTAIRM1和TP53TG1可以在一定程度上促进入神经胶质瘤细胞U87MG的存活。Real timePCR结果显示:HOTAIRM1可以在mRNA水平上调葡萄糖相关蛋白78(glucose-regulated protein,78kDa, GRP78)、己糖激酶2(hexokinase2,HK2)、乳酸脱氢酶A(lactate dehydrogenase A,LDHA)、异柠檬酸脱氢酶1(isocitratedehydrogenase1,IDH1)、异柠檬酸脱氢酶2(isocitrate dehydrogenase2,IDH2)、延胡索酸酶(fumarate hydratase,FH)、琥珀酸脱氢酶(succinate dehydrogenasecomplex,SDH)的表达,下调丙酮酸激酶2(Pyruvate kinase M2,PKM2)的表达。TP53TG1可以在mRNA水平上调GRP78、HK2、丙酮酸激酶1(Pyruvate kinaseM1,PKM1)、LDHA、IDH1、IDH2、FH的表达,下调PKM2的表达。以上的研究结果为探讨HOTAIRM1和TP53TG1在神经胶质瘤中的生物学功能奠定了基础。
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