文冠果bZIP转录因子家族鉴定和非生物胁迫应答模式分析

来源 :东北林业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:chren1981
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文冠果是我国特有的珍稀木本粮油树种,其环境适应能力极强,具有耐寒、耐旱、耐贫瘠、耐盐碱等生理特性。由于文冠果基因组信息不完善,其分子机理方面的研究鲜有报道。碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子家族是真核生物中分布最广泛且最保守的转录因子家族之一,在调节植物的生长发育和响应生物及非生物胁迫中发挥着至关重要的作用。文冠果全基因组测序的完成为从分子层面揭开文冠果抗逆响应机理奠定了基础。本研究首次在文冠果全基因组数据中挖掘bZIP家族基因,并对其进行了系统地分析,得出以下结论:1、根据文冠果全基因组测序信息,从文冠果基因组中鉴定得到64个文冠果bZIP家族转录因子。2、基于XsbZIP与AtbZIP、ZmbZIP和GmbZIP转录因子家族成员的系统发育关系构建进化树,将64个XsbZIP转录因子家族成员分为11个亚家族(A至I,S和U)。3、根据bZIP结构域碱性区和铰链区内含子数量、位置和相位,将XsbZIP基因分为五种模式(a、b、c、d和e)。4、共鉴定出XsbZIP转录因子中的20个保守基序,某些保守基序可能赋予了基因特定的功能。5、相比于串联重复,片段重复在文冠果bZIP基因家族的扩增中发挥了更加重要的作用。6、62个启动子区域序列已知的XsbZIP基因均存在响应激素和逆境胁迫的顺式作用元件。7、大多数文冠果bZIP家族基因在盐胁迫(NaCl)、冷胁迫(4℃)和ABA处理下差异表达,推测XsbZIP基因广泛参与调控文冠果对非生物胁迫的响应。结合非生物胁迫下基因表达模式和前人对其共线性基因的功能的研究,预测XsbZIP11、XsbZIP21、XsbZIP25和XsbZIP35基因在文冠果非生物胁迫响应中发挥着至关重要的作用。
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