【摘 要】
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棉花是重要的经济作物,是纺织业天然纤维的主要来源。棉籽作为棉花的副产物,是人类的第五大植物油来源与蛋白资源。长期以来棉花育种工作中,研究者一直较为注重纤维产量提高与品质的改良,只是将棉籽作为棉花生产的副产品,忽略了其具有研究价值和经济价值,导致棉籽油分与蛋白质的改良研究工作进展缓慢。研究与改良棉籽营养成分等对棉花作物育种工作有着重要的意义。本研究以陆地棉“中棉所36”为受体亲本,高油海岛棉“海1”
【基金项目】
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国家自然科学基金项目基于陆海近等基因渐渗系的纤维长度相关QTL(qFL-12-2)精细定位与候选基因鉴定的部分研究成果(项目编号:U1804103),项目主持人:卢全伟
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棉花是重要的经济作物,是纺织业天然纤维的主要来源。棉籽作为棉花的副产物,是人类的第五大植物油来源与蛋白资源。长期以来棉花育种工作中,研究者一直较为注重纤维产量提高与品质的改良,只是将棉籽作为棉花生产的副产品,忽略了其具有研究价值和经济价值,导致棉籽油分与蛋白质的改良研究工作进展缓慢。研究与改良棉籽营养成分等对棉花作物育种工作有着重要的意义。本研究以陆地棉“中棉所36”为受体亲本,高油海岛棉“海1”为供体亲本进行多代回交自交,得到棉花陆海杂交组合染色体片段代换系BC5F3:5。从中随机挑选300个高质量材料,将其与亲本材料在2015年和2016年分别种植于河南安阳(北纬35°41′-36°21′,东经113°38′-114°59′)和新疆石河子(北纬43°26′-45°20′,东经84°58′-86°24′)的中棉所试验基地,环境简称15AY(2015年安阳)、16AY(2016年安阳)、15SHZ(2015年石河子)、16SHZ(2016年石河子),收取行花用于品质研究。对其棉籽油分含量等表型进行遗传分析后,寻找表型与基因型的对应关系,利用Ici Mapping等软件挖掘与棉籽油分和蛋白质相关的QTL(Quantitative trait loci),对棉籽油分相关候选基因进行筛选并进行初步的功能验证研究。具体如下:1.对该群体2015年、2016年新疆石河子和河南安阳4个栽培环境中的棉籽蛋白质含量、油分含量等主要营养成分及纤维长度、断裂比强度、马克隆值、整齐度指数、伸长率等纤维品质性状进行调查分析,旨在揭示棉花陆海渐渗系BC5F3:5棉籽主要营养成分含量性状之间及其与棉花纤维品质性状间的遗传关系。结果表明,BC5F3:5群体中棉籽主要营养成分及纤维品质性状均呈正态分布,群体中没有出现异常的偏分离,适合进行遗传分析与后期QTL分析。棉籽油分与蛋白质含量的平均值基本接近轮回亲本“中棉所36”,超轮回亲本比例在35.49%-76.00%之间,群体内存在丰富的遗传变异,变异系数的大小位于3.54%-5.95%之间。不同环境下棉籽油分与蛋白质含量、棉花纤维品质之间呈负相关,蛋白质含量与棉花纤维品质之间呈正相关,故利用传统育种方法同步改良具有一定难度。筛选出四个环境下棉籽油分、蛋白质含量与棉花纤维品质均优异的材料各20个,为棉籽油分、蛋白品质与棉花纤维品质QTL挖掘及分子聚合育种等储备了大量的基础材料。2.结合BC5F3:5材料的棉籽成分含量的表型与基因型数据,利用Ici Mapping 4.2.0软件进行QTL定位,定位到13个与油分含量相关的QTLs,表型变异贡献率为1.87%-14.96%,LOD值为3.08-13.20。综合分析各QTL位点,其中D10染色体上定位的QTL表型解释率(PVE)和LOD值较高,且在三个环境中被检测到,因此将D10染色体上的QTL视为稳定QTL。该QTL位于标记NAU3813和NAU3665之间,表型变异贡献率为7.86%-12.25%,LOD值为5.26-13.20,其物理位置位于51.77Mb-54.11 Mb,加性效应为正值,其他11个QTLs都只能在一个环境中检测到。另外,还定位到11个与蛋白有关的QTLs,均只能在同一个环境中检测到,表型变异贡献率为1.24%-10.18%,LOD值为3.12-5.28。3.结合陆地棉TM-1棉花转录组数据库,对稳定油分相关QTL(q OCD10.1)内基因信息进行分析,发现该区间内共有78个基因,结合该78个基因的功能注释与不同时期在陆地棉TM-1、海岛棉7124中的表达量作为对照,最终确定筛选出GH_D10G1962和GH_D10G1973作为候选基因,通过对候选基因的相关蛋白进化关系进行进一步分析,发现种子中油分含量较多的作物(如花生、棉花、油菜、向日葵、芝麻)聚类到一组,在这些作物中GH_D10G1962和GH_D10G1973基因编码的蛋白在进化上功能趋近一致,推测在进化过程中该基因参与油脂合成和代谢过程。在亲本中棉所36和海1胚珠材料c DNA中克隆GH_D10G1962和GH_D10G1973,测序发现:基因GH_D10G1973在975 bp、1184 bp、1791 bp处两亲本间共存在三个碱基的差异,其中2处为同义突变,1处为非同义突变,其蛋白在第395个氨基酸处发生改变。GH_D10G1962在亲本间序列一致。综上,本文通过表型遗传分析筛选出品质优异材料,并结合基因型定位出与棉籽油分有关的QTL,筛选出候选基因并进行初步功能分析,为进一步QTL精细定位和棉花优质育种奠定基础。
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