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油茶是我国南方特有的木本油料植物，本研究建立了AFLPs反应分子体系，分析了其在油茶遗传多样性研究中的适用性，并且初步进行了油茶种间杂交实验。
以油茶基因组DNA为材料，通过试验分析建立了适合油茶且简便易行的AFLP反应体系，筛选出了11对能够反映多态性的有效引物，并对油茶的遗传多样性进行了初步分析，平均每对引物扩增出23个具有清晰条带的位点，其中多态性位点数为20，多态性位点百分率PPL为87.14％，有效等位基因数ne为1.54，Nei’s期望杂合度He为0.36，Shannon多态性信息指数I为0.47。研究结果表明了AFLP标记技术在油茶遗传多样性研究上的适用性，同时也显示了油茶具有较高的遗传多样性，为进一步研究油茶多居群的遗传多样性奠定了重要的理论和技术支持。
采用有性杂交方法对果大、抗病性强的的广西博白大果和其他地区的3个产油率高的油茶即江西小果、南荣小果、攸县油茶分别进行正反品种间杂交，然后对杂交结果率进行统计分析。结果表明：不同种对结果率影响显著，3个组合杂交平均结果率为4.97％，其中以母本为江西小果(白花)的结果率最高，达到8.25％，其次是广西南荣小果为3.67％，而母本为攸县油茶的结果率最低，只有3％，江西小果与广西博白大果的结果率高于其他杂交组合。本实验为油茶杂交育种亲本选配和新品种的选育提供了理论基础。