【摘 要】
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由于物种本身所具有的生态，科研，教育，审美等价值，对濒危物种的保育一直是生物学家和政府关注的重点。然而物种自然居群的遗传多样性对物种生存和进化有着巨大的影响，许多保育工作
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由于物种本身所具有的生态，科研，教育，审美等价值，对濒危物种的保育一直是生物学家和政府关注的重点。然而物种自然居群的遗传多样性对物种生存和进化有着巨大的影响，许多保育工作的重点应该是保护物种现有的遗传多样性。因此，对于濒危物种遗传多样性和居群结构的详细研究对于制定合理有效的保育措施具有非常重要的意义。
马蹄香(SarumaHenryi Oliv.)是我国特有的单种属植物，是一种珍贵的古老孑遗植物的活化石，具有很高的系统发育研究，生态和医药价值。然而由于气候变化和人类活动(生境破坏和采挖)的影响，加上马蹄香对生境的严苛要求，种子的低萌发率，特殊的繁育系统等生物学特性，马蹄香的居群规模锐减，被列为国家濒危植物，亟待保护。
目前对马蹄香的研究主要集中在其生物特性方面。为了更好的揭示马蹄香的遗传多样性与居群结构，本文利用FASCO文库富集法从马蹄香基因组AC和GA富集文库中分离和筛选了14对多态性的微卫星位点，每个位点的等位基因数从5-8不等，平均为7.07个。观察杂合度为0.4762-0.8000，期望杂合度为0.6281-0.8532。这些多态性的引物为马蹄香保护生物学研究提供了有效的工具。
应用6个核基因组SSRs和4个EST-SSRs对马蹄香16个自然居群进行遗传多样性研究。结果表明，马蹄香具有较高的物种遗传多样性(HE=0.9427，h=0.9410，I=3.0213)和居群遗传多样性(HE=0.4441，h=0.4307；I=0.6822)。鉴于马蹄香的濒危现状，高的遗传多样性可能与马蹄香漫长的进化历史和广泛的地理分布有关系。AMOVA分析表明马蹄香居群之间遗传分化显著(GsT=0.5428；FST=0.5524)，基因交流较小(Nm=0.21)。而其高的居群间遗传分化，可能与其特殊的自交主导的繁育系统，遗传漂变，种群波动和地理隔离有关系。贝叶斯分析和主成分分析一致支持16个马蹄香自然居群聚成3个分组，对应3个相应的地理单元。MantelTest分析表明居群间的遗传距离与地理距离有相关性，说明地理隔离对马蹄香居群遗传结构的形成具有重要的作用。
本研究对马蹄香的保育工作有重要的指导意义：马蹄香的保护应该以保护有效居群大小和限制人为破坏活动为主，保护单一的居群对保存马蹄香的遗传多样性没有大的影响。
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