冰岛硫化叶菌引发酶非催化亚基必需性及复制因子C大亚基胞内含量调控的研究

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古菌基因组同时编码细菌DnaG类型引发酶和真核生物类型引发酶,但通常认为真核类型引发酶负责DNA复制过程中引物的合成。硫化叶菌的真核类型引发酶一直被认为是由一个催化亚基PriS和一个非催化亚基PriL组成的异二聚体PriSL。  本研究通过免疫共沉淀的方法鉴定出一个新的非催化亚基PriX,它能与PriS、PriL形成稳定的异三聚体(PriSLX),PriSLX具有远高于PriSL的引发活性,在体外生化特性方面也比PriSL更接近生理需求。我们采用标记插入和未标记目的基因缺失(marker insertion and unmarked target gene deletion,MID)方法分别对冰岛硫化叶菌中的两个非催化亚基PriL和PriX进行体内敲除,得到了插入标记的转化子PriXin和PriLin,但在第二步在选择压力下筛选目的基因缺失突变体时,由PriXin得到的单菌落均为筛选标记自发突变体,而由PriLin得到的单菌落为筛选标记自发突变体或回复突变体。筛选标记自发突变体基因组为部分缺失基因型,但都无法得到缺失突变纯合子。通过连续添加筛选压力富集培养四代后,PriLin全部回复成野生型,而PriXin中的缺失基因型并没有通过富集增加,说明PriX缺失型没有增殖能力。上述实验证明,priX和priL对生长都是必需的,它们在体内的功能都非常重要且不能互补。硫化叶菌的复制因子C(RFC)是由一个大亚基(RFCL)和四个小亚基(RFCS)组成的异五聚体,在体内负责将滑卡因子PCNA装载到引发模板上。RFCL在大肠杆菌中重组表达得到的多为降解产物。我们利用冰岛硫化叶菌遗传操作系统进行了体内同源表达,发现表达载体编码的RFCL超表达时,基因组表达的RFCL的量受到抑制,说明RFCL在细胞内的含量受到调控。定量结果显示,细胞内RFCL的总量相对于RFCS的量维持在一个固定水平。通过Northern blotting和移码突变证明,RFCL含量的调控不是发生在RNA水平上,而是在蛋白质水平上。诱导RFCL超表达时,多余的RFCL被降解,产生一个可检测的片段RFCLcut。RFCLcut缺失了C末端,且不能与RFCS形成复合物。构建了一系列RFCLC末端缺失突变、点突变、移码突变表达载体,确定了RFCL的第224位-229位之间为降解热点区域。同时,还构建了一系列N端突变体,发现N端无论是发生缺失突变、插入突变还是点突变,无论突变发生在保守区还是非保守区,都会影响到RFCL的调控,以致无法检测到切割片段,提示RFCL的完整N末端对该蛋白的调控非常重要。
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