论文部分内容阅读
本研究利用PCR直接测序与克隆测序相结合的方法测定了西藏驹蝗的线粒体基因组全序列，并运用生物信息学的相关方法对西藏驹蝗线粒体基因组的结构、组成、排列顺序、碱基组成特点、蛋白质密码子偏向性等进行了分析。并且联合GenBank中所收录的槌角蝗科其他种类线粒体基因组，采用NJ法、MP法、贝叶斯法和ML法对槌角蝗科的系统发育关系进行了探讨。所获得的主要结论如下：1、本研究所测定的西藏驹蝗线粒体全基因组编码37个基因，即13个蛋白质编码基因，2个rRNA基因，22个tRNA基因，还有一个位于trnI和rrnS之间的非编码区即A+T富含区。与典型的节肢动物线粒体基因组的基因排列顺序相比，存在一处重排，即trnD和trnK位置发生颠倒。2、西藏驹蝗的线粒体基因组基因存在显著的AT碱基偏向性，A+T平均含量为74.2%。对于rRNA和tRNA，它们的A+T含量分别为76.7%和72.9%。A+T富含区的A+T含量达到了84.8%，这一数值明显高于其他基因区域。3、西藏驹蝗的蛋白质基因主要使用标准的ATG为起始密码子（COI的起始密码子为CCG），其次是ATT和ATC，而ATA使用的较少。终止密码子主要是TAA，其次是TAG和TAT。4、基于线粒体基因组基因序列通过NJ法、MP法、ML法和贝叶斯法，重建了槌角蝗科5种蝗虫的系统发育关系。结果显示，4种分子树的树形极为相似，5种槌角蝗科的蝗虫都以100的置信度聚在一起，支持槌角蝗科科级分类地位；西藏驹蝗和西藏高原蝗各自形成一支，西藏大足蝗、李氏大足蝗同红槌角蝗聚集在一起构成一支，支持槌角蝗科亚科分类观点-皱腹蝗亚科、槌角蝗亚科、驹蝗亚科、高原蝗亚科；无听器和发音器、翅极度退化的西藏驹蝗同西藏高原蝗位于树的顶端，是最进化的类群；而翅发达、具发音器和听器的西藏大足蝗与李氏大足蝗位于分子树的底端，为最原始的类群，该结果支持印象初（1982年）基于形态分类学和进化分类学提出的高原蝗虫适应性进化观点。